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五、真核基因转录后水平上的调控 miRNA介绍 (3)沉默子:某些基因含有负性调节元件——沉默子,当其结合特异蛋白因子时,对基因转录起阻遏作用。 3、反式作用因子 (1)定义:与转录单元不在同一条DNA链上,能直接或间接地识别或结合在各类顺式作用元件,参与调控靶基因转录效率的蛋白质。 TFⅡD(TATA)、CTF(CAAT)、SP1(GGGCGG)、HSF(热激蛋白启动区) (2)反式作用因子的结构 DNA结合结构域 A 螺旋-转折-螺旋(Helix-turn-helix B 锌指结构(zinc finger) C 碱性-亮氨酸拉链 D 碱性-螺旋-环-螺旋 I、螺旋-转折-螺旋 II、锌指结构 配位键 2-9个 定义:是一种常出现在DNA结合蛋白中的结构。由一个含有大约30个氨基酸的环和一个与环上的4个Cys或2个Cys和2个His配位的Zn构成,结构像手指状。 Cys2 / Cys2锌指 Cys2 / His2锌指 见于甾体激素受体 见于SP1,TF ⅢA等 转录因子SP1 (GC盒) 、连续的3个锌指重复结构。 III、碱性-亮氨酸拉链 二聚体 亮氨酸之间相互作用形成二聚体,形成“拉链” 。 肽链氨基端20~30个富含碱性氨基酸结构域与DNA结合。 IV、碱性-螺旋-环-螺旋 外显子(Exon) :真核细胞基因DNA中的编码序列,这些序列被转录成RNA并进而翻译为蛋白质。 内含子(Intron) :真核细胞基因DNA中的间插序列,这些序列被转录成RNA,但随即被剪除而不翻译。 第三节 真核生物的基因表达调控 真核生物的基因组 真核生物基因表达调控的特点和种类 真核生物DNA水平上的基因表达调控 真核生物转录水平上的基因表达调控 真核基因转录后水平上的调控(miRNA) Contents (一)真核基因组结构特点 真核基因组结构庞大 3×109 bp、于核膜内 单顺反子 基因的不连续性 断裂基因(interrupted gene)、内含子(intron)、 外显子(exon) 非编码区较多 多于编码序列 (9:1) 含有大量重复序列 一 真核生物的基因组 ● 基因组很小,大多只有一条染色体 ● 结构简单 ● 存在转录单元(操纵子)多顺反子 原核生物基因组结构特点 ● 有重叠基因 (二)、真核细胞与原核细胞在基因转录、翻译及DNA的空间结构方面存在以下几个方面的差异 ① 在真核细胞中,一条成熟的mRNA链只能翻译出一条多肽链,很少存在原核生物中常见的多基因形成的操纵子形式。 ② 真核细胞DNA与组蛋白和大量非组蛋白相结合,只有一小部分DNA是裸露的。 ③ 高等真核细胞DNA中很大部分是不转录的,大部分真核细胞的基因中间还存在不翻译的内含子。 ④ 真核生物能够有序地根据生长发育阶段的需要进行DNA片段重排,还能在需要时增加细胞内某些基因的拷贝数。 ⑤ 在真核生物中,基因转录的调节区相对较大,离启动子较远,几百-上千bp,通过改变整个所控制基因5’上游区DNA构型来影响它与RNA聚合酶的结合能力。 在原核生物中,转录的调节区都很小,大都位于启动子上游不远处,调控蛋白结合到调节位点上可直接促进或抑制RNA聚合酶与它的结合。 ⑥ 真核生物的RNA在细胞核中合成,只有到细胞质后,才能被翻译,原核生物中没有这种空间间隔。 ⑦ 许多真核生物的基因只有经过复杂的成熟和剪接过程,才能顺利地翻译蛋白质。 (三)基本概念 1、基因家族(gene family) 真核生物的基因组中,来源相同、结构相似、功能相关的基因,称为基因家族。 同一家族中的成员紧密排列在一起,构成基因簇(gene cluster) 。 如组蛋白、免疫球蛋白和血红蛋白基因为基因家族 (1)简单多基因家族:其中基因以串联方式前后相连 The eukaryotic rDNA repeating unit (2)复杂多基因家族 有独立的转录单位。形式不同?? Organization of histone genes in the animal genome 2、断裂基因:基因编码区中含内含子 内含子有可变剪接 3、假基因 是基因组中因突变而失活的基因,无蛋白质产物。一般是启动子出现问题。 二、真核生物基因表达调控的特点和种类 (一)特点 1、RNA聚合酶 3个 2、多层次 3、个体发育复杂 4、活性染色体结构变化:对核酸酶敏感 、DNA拓扑结构变化 、DNA碱基修饰变化 、组蛋白变化 5、正性调节为主 6、转录与翻译分开进行 7、转录后RNA需修饰、加工 根据其性质可分为2类: 1、瞬时调控或称为可逆性调控,相当于原核细胞对环境条件变化所做出的反应。包括底物或激素水平升
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