合作猪SLA_DQA基因第4外显子多态性分析_张国华.docVIP

?研究报告?  生物技术通报 BIOTECHNOLOGY BULLETIN  2014年第2期  合作猪 SLA-DQA 基因第 4 外显子多态性分析  张国华1  马小军1，2  吕伟丽1 （1. 甘肃农业大学 动物医学院，兰州 730037 ；2. 甘肃省草食动物生物技术重点实验室，兰州 730070）  摘  要 ： 合作猪的 MHC-DQA 基因的适应性变异，其抗原识别区域（即外显子 4）通过 PCR 扩增和随后的单链构象多态性 （SSCP）和序列分析，结果显示在 439 个合作猪个体，SLA-DQA 第 4 外显子检出 4 个等位基因和 6 个基因型（AA、BB、DD、AB、 AC 和 AD），其中 A 等位基因和 AA 基因型的频率最高，为优势基因和优势基因型。对不同型的 PCR-SSCP 条带测序分析，发现 7 个突变位点（5 068 bp T → C，5 109 bp 和 5 149 bp 处缺失 C，5 131 bp A → G 导致丝氨酸变为甘氨酸，5 135 bp C → T，5 234 bp G → A，5 136 bp 处插入 A）。遗传学分析发现，合作猪多态信息含量（PIC）为 0.240 1，属于低度多态，各种基因型的分布不显著。 研究结果证实，合作猪 SLA—DQA 基因第 4 外显子为低度多态。 关键词 ： 合作猪 SLA