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VOLUME 4 NUMBER 5 NOVEMBER 2010 · · JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY O R I G I N A L R E P O R T 微阵列数据谱聚类分析表明微环境重塑以及免疫反应在头颈部鳞状细胞癌 患者生存中的作用 Johanna K. Thurlow, Claudia L. Peña Murillo, Keith D. Hunter, Francesca M. Buffa, Shalini Patiar, Guy Betts, Catharine M.L. West, Adrian L. Harris, Eric K. Parkinson, Paul R. Harrison, Bradford W. Ozanne, Max Partridge, and Gabriela Kalna 刘进 译 蒋国樑 审校 目的：通过对微阵列数据进行非监督统计分析，鉴定与头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)预后相关的基因集。 患者与方法：对14例正常口腔上皮标本和71例取自有预后资料患者的HNSCC标本进行微阵列分析。数据集的谱聚类(SC)分析鉴定 了体现样本间基因表达异质性不同坡向的多重向量。对向量基因列表的基因功能分类体系(GO)分析确定了在已明确的生物学通 路中富集的基因集。通过Cox生存分析确定这些基因集的预后意义。 结果：最有影响的谱聚类向量是V2和V3 。V2把正常标本和肿瘤标本区别开来。V2基因列表的GO分析确定了HNSCC样本间异质 性基因表达的通路，尤其是粘着斑(FA)/细胞外基质重建通路和细胞因子-细胞因子受体(CR)相互作用的通路。对V3基因列表进 行的相似的分析明确了CR通路上更大程度的异质性。V2CR基因代表先天性免疫反应，而V3CR基因的高表达代表不依赖于人 乳头瘤病毒状态的适应性免疫应答。生存分析表明FA基因集预示预后较差，而通过CR基因集对适应性免疫应答的分类预示了 好的预后。FA和CR的联合模式显著超越了现有临床分类指标的性能(在我们这组患者中P 0.001，更重要的是，在另一个独立的 60例HNSCC患者组中P =0.007)。 结 论 ：采用 S C 和 G O 分析 HNSCC 微阵列数据，鉴定 了对预测患者预后有高度 意义的基因集。将来的大规 模研究将会确立这些基因 集在HNSCC 临床治疗中的 应用价值。 J Clin Oncol 28:2881-2888. © 2010 by American Society of Clinical Oncology 图3. 粘着斑(FA)和细胞因子-细胞 因子受体(CR)分类Kaplan-Meier 图。按照V2FA基因表达、V3CR/ V2CR 比、或二者兼有之，对样 本进行分类。(1~3)疾病特异性生 存。(4) 无复发生存。(A)本研究 队列中所有的头颈部鳞状细胞癌 (HNSCCs)。(B)仅原发HNSCCs。 (C)采用可获得的终点分析Chung 等入组的HNSCC患者。  Downloaded from on April 29, 2014 . For personal use only. No other uses without permission.Downloaded from on April 29, 2014 . For personal use only. No other uses without permission.Downloaded from on April 29, 2014 . For personal use only. No other uses without permission. Copyright © 2010 by the American Society of Clinical Oncology. All rights reserved.Copyright © 2010 by the American Society of Clinical Oncology.