马铃薯卷叶病毒陕西分离物外壳蛋白（CP）的生物信息学分析.pdfVIP

( ) 西北大学学报 自然科学版 2010 6 ， 40 3 ，Jun. ，2010 ，Vol. 40 ，No. 3 年 月 第 卷第 期 Journal of Northwest University (Natural Science Edition) 马铃薯卷叶病毒陕西分离物外壳蛋白(CP)的 生物信息学分析 1 2 3 1 1 ， ， ， ， 颜永杰 吴 宽 张 珏 高云芳 谢海峰 (1. ， 7 10069 ;2 . ， 7 10069 ; 西北大学生命科学学院 陕西西安 西北大学信息科学与技术学院 陕西西安 3. ， 7 12100) 西北农林科技大学生命科学学院 陕西杨陵 : (PLRV) 。 DNA- 摘要 目的 分析预测马铃薯卷叶病毒 外壳蛋白的理化性质及结构 方法 应用 MAN 软件、ExPASy 中的ProtParam 工具，SignalP ，LipoP 程序，TMHMM ，PSIPRED 和3D-PSSM 等方 法， PLRV ·CP 、 、 、 、 、 、 分析 的核苷酸基本特征 蛋白质理化性质 亲疏水性 可溶性 信号肽 跨膜结构域 、 、 。 PLRV ·CP ， PLRV ·CP 。 二级结构 保守区域 三级结构等 结果 陕西 与已报道的 高度同源 蛋 ， ， 。 白序列分析显示无跨膜螺旋结构 不属分泌蛋白 是可溶的亲水性蛋白 二级结构主要为折叠和无 ， 。 ， 。 规则卷曲 不含转角 三级结构保守区预测表明 该蛋白属于黄化病毒属外壳蛋白成员 结论 对 、 。 马铃薯卷叶病毒外壳蛋白的生物信息学分析为进一步研究其功能 探索抗病途径奠定了基础 : ; ; 关 键 词 马铃薯卷叶病毒 外壳蛋白 生物信息学 中图分类号:S43 文献标识码:A 文章编号:1000-274 Ⅹ (20 10)03-0473-04 Bioinformatics analysis on coat protein of Potato Leafroll Virus from Shaanxi isolation 1 2 3