马铃薯StSnRK2_2基因克隆与生物信息学的分析.pdfVIP

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2017-09-04 发布于安徽
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马铃薯StSnRK2_2基因克隆与生物信息学的分析.pdf

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植物研究 2013 ，33 (3):294 ～ 301 Bulletin of Botanical Research 马铃薯StSnRK2． 2 基因克隆与生物信息学分析 1，2 ，3 1，2 ，3 1，2 ，3 1，2 ，3 1，2 ，3 * 1，2 ，3 范阿棋毛娟刘思妍张俊莲王蒂白江平 (1．， 730070 ;2 ．， 730070 ;3 ．甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室兰州甘肃省干旱生境作物学重点实验室兰州甘肃农业大学农， 730070) 学院兰州 ‘ 3 ’(Solanum tuberosum) ， RT-PCR cDNA 摘要以马铃薯陇薯号为试材采用方法从马铃薯中克隆得到一个 SnRK (Sucrose non-fermenting 1-related protein kinase ) ， StSnRK2. 2 ， GenBank ，基因命名为提交注册注册号为 JX280912 。， 1 020 bp ， 339 ， 38． 33 kDa ，通过生物信息学分析该基因开放阅读框全长编码个氨基酸蛋白质分子量为 5 ． 93 ，- 43． 36% ， 16． 22% ，- 6． 78% ， 33． 63% ，、，等电点为 α 螺旋延伸链 β 折叠无规则卷曲无信号肽不跨膜是一个膜。。， StSnRK2． 2 内蛋白亚细胞定位分析预测主要存在于细胞核中氨基酸序列同源性比较发现马铃薯基因与其他 SnRK2 ， PK 11-C5 ，目前已报道的抗逆效果显著的家族基因具有较高同源性同烟草基因的同源性最高相似性达 90 ． 56% ，。 13 、4 在系统进化树中处于同一进化分枝上并通过分析得到该基因具有处丝氨酸磷酸化位点处苏氨酸 4 ， Ser / Thr ，， SnRK2 磷酸化位点和处酪氨酸磷酸化位点可能与植物体内蛋白激酶有关因此推测