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西北植物学报 ,2013,33(9):1762—1767
ActaBot.Borea1.-Occident.Sin.
文章编号 :1000—4025(2013)09—1762—06
美洲黑杨遗传差异的SRAP和 EST—SSR分析
郭 娟 ,樊军锋 ,梁 军
(1西北农林科技大学 林学院,陕西杨陵 712100;2中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所,北京 100091)
摘 要 :采用 SRAP和 EST—SSR分子标记对美洲黑杨 I一69及与其有亲缘关系的4个美洲黑杨 品种进行遗传差异
分析 ,比较两种分子标记在遗传差异性分析 中的适用性,为美洲黑杨的鉴别提供准确 的分子技术依据 。结果表 明:
(1)以SRAP标记筛选 出21对 引物组合 ,共扩增 出287条谱带,多态性条带 209条 ,多态性 比率 72.8 ,遗传相似
系数为0.5481~o.7692。(2)以EST—SSR标记筛选出 17对引物 ,共扩增 出86条谱带,多态性条带 69条 ,多态性
比率 80.2 ,遗传相似系数为 0.4444~0.7172。(3)对 SRAP和EST—SSR以及两者混合数据形成的3个遗传相
似矩阵进行相关性分析结果显示 ,SRAP和 EST—SSR分别 同综合数据之间呈显著相关 (r一0.8442,r=0.8308)。
(4)聚类分析发现 ,两种分子标记 的聚类结果有一定差异,SRAP聚类结果 同综合数据分析的结果一致 ,说明SRAP
标记更适用于杨树亲缘关系较近材料的遗传差异分析 。
关键词 :美洲黑杨 ;SRAP;ESTSSR;遗传差异
中图分类号 :Q789 文献标志码 :A
GeneticDifferenceAnalysisofPopulusdeltoides
UsingSRAP andEST-SSR M arkers
GUOJuan ,FAN Junfeng ,LIANG Jun
(1CollegeofForestry,NorthwestAFFUniversity,Yangling,Shaanxi712100,China;2TheResearchInstituteofForestEcolo
gY,EnvironmentandProtection,TheChineseAcademyofForestry,Beijing100091,China)
Abstract:BothSRAP andEST—SSR markerswereusedtoanalysisgeneticdifferenceof5Populusdeltoides
varietiesincludingP.deltoides.cv.L‘ux’(I一69/55)and4varietiesrelatedtoit.(1)InSRAPanalysis,21
primerpairswerescreenedand287bandswereamplified,ofwhich209bandswerepolymorphie.Theper—
centageofpolymorphicbandswas72.8 andthegeneticsimilaritycoefficientsrangedfrom 0.5481to0.
7692.(2)In ES SSR analysis,l7primerswerescreenedand86bandswereamplified,amongwhich 69
bandswerepolymorphic.Thepercentageofpolymorphicbandswas80.2 andthegeneticsimilaritycoef—
ficientsrangedfrom 0.444 4 to 0.7172.(3)Thecorrelation ofthegeneticsimilaritymatrix among the
SRAP.EST—SSR andthecombinationdataweredifferent。ofwhichthecorrelationbetweenSRAP andthe
combinationdata (r一0.8442),EST—SSRandthecom
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