应用nanoLC-MSMS分析毛白杨次生维管系统的蛋白质表达谱.pdfVIP

第 49卷 第 5期 林 业 科 学 Vo1．49．No．5 2013年 5 月 SCIENTIA SILVAE SINICAE May，20 13 应用 nanoLC—MS／MS分析毛 白杨次生维管 系统的蛋 白质表达谱 木 蒋淑磊 陈加飞 。 赵树堂 卢孟柱 (1．林木遗传育种 国家重点实验室 北京 100091；2．中国林业科学研 究院林业研究所 北京 100091； 3．中国林业科学研究院林业新技术研究所 北京 100091) 摘 要 ： 基于 1DE的nanoLC—MS／MS方法分析毛白杨次生维管系统的蛋 白质组，成功鉴定：14个蛋 白质参与细 胞分裂，7个转录因子 ，22个与细胞骨架相关蛋 白质，31个与细胞信号转导相关蛋 白质，14个与细胞壁相关蛋 白 质。显示这些蛋 白质相应基因参与形成层活动的调控，为进一步了解木材形成的分子机制奠定基础。 关键词： 液相色谱一串联质谱；蛋 白质表达谱；次生维管系统；毛 白杨 中图分类号 ：$718．46 文献标识码 ：A 文章编号 ：1001—7488(2013)05—0043—11 ProteomeProfilein SecondaryVascularSystem ofPopulustomentosabynanoLC-M S／M S JiangShulei ChenJiafei， ZhaoShutang ， LuMengzhu · (1．StateKeyLaboratoryofTreeGeneticsandBreeding Betling100091；2．ResearchInstituteofForestry，ChineseAcademyof Forestry Beijing100091；3．ResearchInstituteofForestryNewTechnology，ChineseAcademyofForestry Beifing100091) Abstract： Astheuppermostcarbonpoolandimportantrenewablesource，woodhasdualfunctionsinbothrespondingto theglobalclimatechangeandmeetingtheresourcedemandsofhuman society，therebyitisessentialtounderstand the molecularmechanism ofwood formation． In thisstudy，a 1DE-based nanoLC—MS／MS method wasintroduced to analyze theproteome in the secondaryvascularsystem ofPopulustomentosa，and theidentifiedproteinsincluded：14proteins associated celldivision；7proteinsrelated totranscription factors；22proteinsassociatedwith cytoskeleton；31proteins associatedwith signaltransduction；and 14proteinsassociatedwith cellwallfomr ation．Thecorresponding genesofthese proteinsparticipate in regulating cambialactivity．The accomplishmentofthisproteomeanalysislaid a foundation for furtherunderstandingthemolecularmechanism ofwoodformation． Keywords： LC—MS／MS；proteomeprof