自组装谷氨酸螺旋纳米管的分子模拟.pdf

兰奎鎏墨苫銮兰王兰要圭兰竺垒兰．．．．—．．．。。—s 自组装谷氨酸螺旋纳米管的分子模拟 摘要 计算机分子模拟研究可以从原子水平的分子模型来模拟分子的结构、行 为，进而预铡体系的各种物理、化学性质，因而可以对物质材料给出在原予 分子水平上的微观图像。为系统地研究和开发新型材料提供更多的理论依 据。其重要性己得到了广泛的认识。 谷氨酸球形螺旋纳米管的结构进行了研究，主要内容包括： 对球形螺旋纳米管的结构及二十烷二羰基二-L一谷氨酸分子(EDGA) 的特点进行分析研究，根据EDGA分子在纳米管壁中的受力情况，以一个 EDGA分子为结构单元，确定了相当于=维周期边界条件腑二维周期边界模 型和EDGA单层膜聚集体模型。由分子动力学构象搜索法寻找到能量最低 的分子构象。并以能量最低构象的EDGA分子搭建出不同尺寸大小的单分 子膜聚集体，运用分子力学、分子动力学交替进行的退火算法对EDGA单 层膜聚集体进行模拟，得到不同生长情况下EDGA单层膜聚集体的聚集状 态，并最终得到了弯曲与扭转两种趋势同时存在的单层膜聚集体，其结构可 以合理蟾解释自组装二十烷二羰基二．L谷氨酸球形螺旋纳米管的螺旋和管 壁突起结构。 关键词分子模拟；分子力学；分子动力学：构象搜索；自组装纳米管 兰蕾鎏蛋王查兰王兰鎏圭2：鳘鲨吝．．．． Helix Molecular ofSelf-assembled Modeling GlutamicAcid Nanotubefrom Abstract hasbeen forits The of simulation importance recognized computer broadly oftheoreticalmodelsatatomicandmolecular gi讥ngapparentimages level， which theoreticalfoundationforthe ofnew providing systematicstudying materials． In to this molecular hasbeenused the thesis，a modelingapproach study of from structureself-assembledhelical special--nanotubeseicosenedioyl--dl·-L·· acidEDGAwith the Cerius2on workstation glutamic s西3S00．n把main are contentsasfollow： modeledathree