第一类肽链释放因子结构与功能研究的新进展 New Progress in Function and Structure of The Class Ⅰ Polypeptide Release Factors.pdfVIP

Reviewsand Monographs PI II,‘豢蓊器乞…妣 、)1wnⅣ．pibb．ac．cn 第一类肽链释放因子结构与功能研究的新进展宰 陈洁柴宝峰梁爱华” (化学生物学和分了上程教育部重点实验室，山西人学牛物技术研究所，太原030006) 摘要蛋白质牛物合成过程的终l卜是由于第一类肷链释放因子识别终止密码子，并导致肽酰．tRNA酯键水解，释放出新合 成的多月太链．近期，通过冷冻电镜、结晶学、核磁共振、分子动力学和牛物化学等方面的研究，使第一类肽链释放因子的结 构与功能逐渐清晰．对近期的研究进行了分析和整理． 关键词第。类肽链释放因子，冷冻电镜，晶体结构，核磁共振，分子动力学 学科分类号Q753 DOI：10．3724／SP．J．1206．2008．00780 蛋白质合成的整个过程包括在核糖体上发生的 肽链合成的起始、延伸、终止并释放新生肽链等几 母Y．M结构域位于Y的茎部，其总体形状和空 个步骤，其中的终止过程主要由两类肽链释放因子 release factor，RE)参与．第一类肽链释模型[31．eRFl的3个结构域都属丁仅一B三明治结构 (polypeptide 放因子为密码子特异性因子，负责识别终止密码子 簇，但是具有不同的拓扑学结构．N结构域中包含 并诱导肽酰一tRNA的水解，而第二类肽链释放因4个B折叠形成的簇，两侧是d螺旋，其中仅2和 子则是一类GTP酶，为密码子非特异性，协助第 仅3形成反平行的螺旋发夹堆积在B折叠的一侧， 一类肽链释放因子行使功能【”． 在螺旋和B折替的界面间形成明显的沟，这种结 真核及原核生物中第一类肽链释放因子的功能 构特点对终止密码子的识别具有极其重要的作用． 不尽相同，原核生物中有两种第一类肽链释放 第一类肽链释放因子N端的螺旋dl与C结构域形 因子RFl和RF2，RFl识别UAG～AA，RF2识别成了一个界面．M结构域的特点是d5螺旋的N端 UGA／UAA，而在大多数真核牛物中只有一种第一偏离结构域主体达25A，并且在高度保守的GGQ 区不具有二级结构，而是形成转角，并与M结构 类肽链释放因子eRFl，负责识别3个终止密码 子．但有趣的是，纤毛虫虽然是真核生物，但在其 中的一些物种中却发现也有两种第一类肽链释放网 NMR对溶液中的M结构域进行构象分析，结果表 子，可能与纤毛虫终止密码子编码氨基酸的现象有 明：溶液构象与晶体结构在GGQ模块上有较大的 关[21．这就意味着这些生物中第一类肽链释放因子 差异．GGQ模块在溶液中的构象具有更大的柔性， 识别终止密码子的机制与高等真核牛物存在差异． 在NMR动力学分析中具有较快的质子交换速率和 人eRFl晶体结构的解析使人们对第一类肽链释放相对缓慢的构象重排．此外，在GGQ模块C端仅 因子的精细结构有了直观的认识，而第一类肽链释 螺旋的尽头还有一个loop结构，在动力学研究中， 放因子如何识别终止密码子?在纤毛虫中终止密码 子为什么会编码氨基酸?新生肽链的释放机制是怎 样的?这些问题已经成为第一类肽链释放因子结构 与功能关系研究的热点． +国家自然科学基金资助项目30770294)． ··通讯联系人． 1第一类肽链释放因子的结构 Tel：0351·7018731，E-mail：aliang@SXU．edu．cn 收稿日期：2008一11．13，接受日期：2009-01—19 人肽链释放因子的晶体结构表明：eRFl由 万方数据 ·818· 生物化学与生物物理进展Prog．Biochem．Biophys． 式，可能也