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Ch5 遗传算法 5.1生物学基础知识 生物从其亲代继承特性的现象称为“遗传Heredity”。 研究这种生命现象的科学称为“遗传学Genetics”。 构成生物的基本结构和功能单元为“细胞(cell)”。 细胞中含有的一种微小的丝状化合物称为“染色体(C)”。生物的所有遗传信息都包含在染色体中。 遗传信息是由基因(Gene)组成的。生物的各种特性由其相应的基因所控制。基因是遗传的基本单位。 细胞通过分裂具有自我复制的能力。 细胞分裂的过程中，其遗传基因也同时被复制到下一代，从而其特性也被下一代所继承。 染色体主要是由脱氧核糖核酸(Dexoyribonucleic Acid DNA)组成，还有蛋白质。DNA在染色体有规则排列，它是个大分子的有机聚合物，其基本结构单位是核苷酸。 每个核苷酸由四种碱基(A-腺嘌呤 T 胸腺嘧啶 G-鸟嘌呤 C-胞嘧啶)形成的环状有机化合物、分子戊糖和磷酸分子组成。 许多核苷酸通过磷酸二酯键相结合，形成一个长长的链状结构，两个链状结构再通过碱基间的氢键，有规律地扭合在一起，相互卷曲起来形成一种双螺旋结构。 低等生物中还含有一种核糖核酸(Ribonucleic Acid 简称为RNA)，其结构与DNA类似。 基因是DNA或RNA长链中占有一定位置的基本遗传单位。 生物的基因数量，根据物种的不同而不同。 小的病毒只有几个基因，高等动物的基因有数万计。 DNA中，遗传信息在一长链上按一定的模式排列，称为遗传编码。 一个基因或多个基因决定了组成蛋白的20种氨基酸的组成比例及其排列顺序。 遗传基因在染色体中所占据的位置称为基因座(LOcus)。 可在同一基因座中出现的全部基因称为等位基因(Allele)。 某种生物所特有的基因及其构成形式称为该生物的基因型(Genotype) 该生物在环境中呈现出的相应特性称为该生的表现型(Phenotype) 一个细胞核中所有染色体所携带的遗传信息的全体，称为基因组(Genome) 丝状染色体(DNA(核苷酸(碱基，遗传信息(基因(几百到几万碱基对排列。 细胞在分裂时，遗传物质DNA通过复制(Reproduction)而转移到新产生的细胞中，新细胞继承旧细胞的基因。 有性生殖时，两个同源染色体之间通过交叉(Crossover)而重组，亦即在两个染色的某一相同位置DNA被切断，其前后两串分虽交叉组合而形成两个新的染色体。 细胞复制时，还可能发生变异(Mutation)而发生新的变化，但是其可能性很小。 进化 生物在其延续生存的过程中，逐渐适应于其生存环境，使得其品质不断得到改良，这种现象称为“进化(Evolution)”。 生物的进化是以集团的形式共同进行的，这样的团体称为群体(population)。群体中的单个生物称为个体(individual)。每个个体对其生存环境都有不同的适应能力，这种适应能力称为个体的适应度(Fitness)。 达尔文的自然选择学说(Natural Selection)构成了现代进化论的主体：通过生物间的交配以及其他一些原因，生物的基因有可能发生变异而形成一种新的生物基因，这部分变异了的基因也将遗传到下一代。虽然这种变化的概率可预测，但具体哪个个体发生变化却是偶然的。 这种新的基因依据其与环境的适应程度决定其增殖能力，有利于生存环境的基因逐渐增多，而不利于生存环境的基因逐渐减少。 通过这种自然的选择，物种将地向适应于生存环境的方向进化，从而产生优良的物种。 遗传与进化的系统观 1、生物的所有遗传信息都包含在其染色体中，染色体决定了生物的性状或特性。 2、染色体是由基因及其有规律的排列所构成的，遗传和进化过程发生在染色体上。 3、生物的繁殖过程是由其基因的复制过程来完成的。 4、通过同源染色体之间的交叉或染色体的变异会产生新的物种，使生物新性状。 5、对环境适应性好的基因或染色体，比差的个体有更多的机会遗传到下一代。 5.2 遗传算法简介 模拟生物在自然环境中的遗传和进化过程，而形成的自适应的全局优化概率搜索算法。 60年代，Holland对自然和人工自适应系统的研究。 70年代，DeJong基于遗传算汉的思想，在计算机上进行大量的纯数值函数优化计算实验，80年代，Goldberg对其进行归纳和总结，形成了遗传算法的基本框架。 函数优化算法 max f(X) 1-1 s.t. X(R 1-2 R(U 1-3 X=[x1,x2,…,xn]T称为决策变量。 f(X)称为目标函数 式(1-2)、(1-3)为约束条件。 U为基本空间 R为U的子空间，满足约束条件的解X称为可行解。集合R表示所有可行解的集合。 在复杂情况下，要想完全精确地求出其最优解既不可能，也不现实。 因而求其近似解是人们的主要着眼点。其方法有： (1)枚举法。效率低