降解组测序技术在植物miRNA的研究中应用.pdfVIP

植物学报 Chinese Bulletin of Botany 2013, 48 (3): 344–353, doi: 10.3724/SP.J.1259.2013.00344 ·专题论坛· 降解组测序技术在植物miRNA研究中的应用 1 1 1 1* 2* 董淼 , 黄越 , 陈文铎, 徐涛 , 郎秋蕾 1浙江理工大学生命科学学院, 杭州 310018; 2杭州联川生物技术有限公司, 杭州 310018 摘要 目前, 利用芯片技术和miRNA测序可快速、准确地检测到物种中所含有的miRNA。随着越来越多的miRNA被发现, miRNA靶基因的确定已成为研究miRNA生物学功能的关键。传统的miRNA靶基因的寻找主要依赖生物信息学预测、AGO 蛋白免疫共沉淀和荧光素酶法等。随着高通量测序技术的持续革新, 出现了一种新的miRNA靶基因的检测方法, 即降解组 测序(degradome sequencing)法, 该方法拥有高通量测序技术、生物信息学分析和RACE验证三者的优势, 并已成