中国鹿亚科动物的遗传分化研究.pdfVIP

第四部分繁殖育种篇 中国鹿亚科动物的遗传分化研究 涂剑锋杨福合邢秀梅杨颖鲁晓萍 (中国农业科学院特产研究所吉林省特种经济动物分子生物学重点实验室 吉林132109) GeneticDifferentiationofCervinaeinChina TU YANGFu·heXINGXiu-meiYANG LU Jian-feng Ying Xiao-ping (JllinProvincial forMolecularof Economic of Economic KeyLaboratory BiologySpecial Animals，InstituteSpecial AnimanlandPlantof 132109) Science，CAASJILin 并结合GenBank检索到我国的2种鹿亚科动物同源序列进行分析．结果显示：我国鹿亚科动物D—loop 区序列全长在92l一1072bp之间，序列中存在重复单元，碱基T、A、C、G的平均含量分别为32．1％、 豚鹿并入鹿属的观点．以控制区全序列为基础构建的系统进化树结果表明梅花鹿、马鹿和白唇鹿亲缘 较近，它们与水鹿构成一组进化枝，而坡鹿与麋鹿构成一组进化枝，以上两枝最后与豚鹿并在一起． 关键词：鹿亚科；遗传分化 鹿亚科也叫真鹿亚科，主要分布在亚洲、欧洲和美洲，共分为四个属：鹿属(Cervus)、站鹿属 属的梅花鹿(Corvus 花鹿属的豚鹿(Axis davidianus)7个物种，其中白唇鹿和麇鹿 porcinus)和麇鹿属的麋鹿(Elaphurus 的原产地就在我国。国内外研究者已从形态学、行为学、生理生化、保护生物学、遗传学等方面对鹿 亚种动物进行了广泛研究，而对我国所有鹿亚科物种的遗传分化研究报道较少。 线粒体DNA控制区(D．100p区)是一段非编码序列，其进化速率较快，最易发生变异，常用于 近缘物种的研究。本研究对我国5个鹿亚科动物种线粒体DNA控制区全序列进行测定，并结合 GenBank中检索到的麋鹿和豚鹿的同源序列，以毛冠鹿为外群，进一步在分子水平上阐述我国鹿亚科 动物的遗传分化。 1材料与方法 I．I材料 东北马鹿、东北梅花鹿、坡鹿、水鹿样和白唇鹿血样。糜鹿、豚鹿及毛冠鹿序列来自GenBank 数据库(表1)。 ·179· 1．2基因组DNA提取 用基因组提取试剂盒提取总DNA，紫外分光光度计定量，．20℃保存。 1．3 PCR扩增、纯化和测序 通过序列比对，在D．100p区两端保守位置设计1对通用引物，引物序列为：上游5’ 成。 用胶回收试剂盒对PCR产物进行回收纯化，纯化后的产物由上海生工完成测序工作。 1．4序列分析和构建系统发育树 构建最大似然法系统发育树(Tamura-Nei模型)。 表1本研究所用材料及说明 Table1 Materialsusedinthis and studyspecification 2结果 2．1 D-loop区序列及差异 通过序列比对，确认本研究测得的5个鹿亚科动物线粒体D—loop区全序列(序列已上传，表1)， bp 态位点主要分布在序列两端(图1)。各动物间的遗传距离范围在0．064--0．106(表2)。 表2鹿亚科动物间D-loop区遗传距离和标准误 Table2 Geneticdistancesandstandarderrorfor control inCawinae