SARS冠状病毒基因溯源分子生物信息学分析.pdfVIP

ofH,．alth Vol17‰9 中国l!生稳孽奢杂志2007年9月第17卷第9期ChineseJournal LaboratoryTeehaolo口．Sep2007 【论著】 SARS冠状病毒基因溯源分子生物信息学分析 张家敏1．王志刚2 (1．浙江医学高等专科学校，杭州310053；2．浙江省疾病预防控制中心，杭州310009) 列进行了分析，以Breda病毒为外组，构建了SAILS冠状病毒和SAgS样冠状病毒系统进化树，并进行单核苷酸变异分析。 结果：发现两次SAILS自然流行的病毒可分为两个明显不同的聚类；第二次流行时从人类中分离的SAPS冠状病毒和从 果子狸等动物中分离的SARS样冠状病毒可分为两个基因型，两型的主要鉴别依据是病毒的全基因组变异而非Spike基 因序列。结论：前后两次SAILS自然流行病毒可能以不同的特性感染人类而不是简单的重复。结合流行病学资料．对第 二次流行时的SARS冠状病毒进行分子水平溯源分析的结果表明．分离自前2例指标