一株高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒变异毒株的基因组特征.docVIP

一株高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒变异毒株的基因组特征 杨小蓉，荫硕焱，潘梦，周磊，盖新娜，陈艳红，郭鑫，杨汉春（中国农业大学动物医学院，北京 100193） 引言 由猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）引起的猪繁殖与呼吸综合征已成为危害全球养猪生产的重要经济性疫病之一。我国高致病性PRRSV[1-]已成为近年来引发我国PRRS疫情的优势流行毒株[]，是否变异值得关注。本研究对从发生猪繁殖与呼吸综合征的猪场分离到的一株PRRSV进行了全基因组序列测定和基因组特征分析，为高致病性PRRSV的变异监测和分子流行病学分析提供必要的科学依据。 材料方法 用于分析的毒株—PRRSV SD0901于2009年分离自山东地区发生PRRS猪场病猪血清样本。采用文献[]报道的引物序列，分段进行毒株基因组的RT-PCR扩增，克隆至载体 pEASY-Blunt Cloning Vector，进行序列测定。应用DNAStar、ClustalX、GeneDoc等生物学软件进行全基因组序列拼接比对与分析。 结果 序列测定与分析表明，不包括Poly (A)，SD0901的基因组全长为15 320 nt，与高致病性PRRSV分离毒株的全基因组核苷酸同源性为98.6%-98.7%；基因组的Nsp2编码区除存在与高致病性毒株相同的30个氨基酸的不连续缺失外，还存在468位的异亮氨酸缺失，且在585-586位氨基酸之间插入1个脯氨酸；该毒株的结构蛋白GP2、GP3、GP4和M编码区分别存在1个氨基酸的突变，即GP2的240位丝氨酸（S）突变为苯丙氨酸（F），GP3的66位异亮氨酸（I）突变为苏氨酸（T），GP3的151位、GP4的43位和M蛋白的7位天冬氨酸（D）突变为天冬酰胺（N）。该毒株在全基因组核苷酸水平上与已报道的高致病性毒株高度同源，除了Nsp2编码区存在与高致病性毒株相同的缺失而外，还缺失和插入，突变这些变异的生物学意义有待深入研究可以认为SD0901是一株高致病性毒株的变异毒株高致病性PRRSV毒株的进一步变异无疑将增加毒株的多样性。 参考文献 [1] Tian KG, Yu X, Zhao T, et al., Emergence of fatal PRRSV variants: unparalleled outbreaks of atypical PRRS in China and molecular dissection of the unique hallmark. PLoS One. 2007, 2: e526. [2] Zhou Y.J, Hao X.F, Tian Z.J, et al., Highly virulent porcine reproductive and respiratory syndrome virus emerged in China. Trans. Emerg. Dis. 2008, 55, 152-164. [3] Zhou L,Chen S.X, Zhang J.N, et al., Molecular variation analysis of porcine reproductive and respiratory syndrome virus in China. Virus Res. 2009, 145, 97-105. [4] Zhou L, Zhang J.N, Zeng J.W, et al., The 30-amino-acid deletion in the Nsp2 of highly pathogenic porcine reproductive and respiratory syndrome virus emerging in China is not related to its virulence . J. Virol. 2009, 83: 5156-5167. 附件一：详细摘要模板