4种海参16SrRNA和COI基因片段序列比较及系统学的研究.pdfVIP

第15卷第6期 中国水产科学 Vo l . 1 5 N o . 6 2008 年11月 Journal of Fishery Sciences of China November 2008 4 种海参16S rRNA 和COI 基因片段序列比较及系统学研究 陈丽梅 李琪 李赟 ， ， (中国海洋大学水产学院，山东青岛 26603) 摘要 ：采用 PCR 技术对来自山东荣成、长岛、俄罗斯和日本的刺参(Apostichopus japonicus)，来自澳大利亚的黄乳海参 Holothuria fuscogilva Cucumaria frondosa Mensamaria interce- ( )，来自冰岛的北大西洋瓜参( )和来自福建的二色桌片参( dens)的 16S rRNA 和 COI 基因片段进行了扩增和测序，分别得到了长度约为 500 bp 和 540 bp 的片段。通过统计变异位 16S rRNA COI 点、平均核苷酸差异数和核苷酸多样性指数进行基因序列变异分析。结果表明，根据 、 基因片段进行刺参种 内差异比较时，长岛和荣成刺参序列差异最小，和日本刺参序列差异最大；刺参和其他科 3 种海参种间的序列差异远远高 GenBank 7 NJ ME 于刺参种内差异。从 中选取 条海参序列与本研究所测序列一同构建了 和 系统树。根据 2 种基因片段 的系统学分析均表明，刺参属和拟刺参属亲缘关系很近，可能有共同的起源。而海参科未与同属于楯手目(Aspidochirolida) 的刺参科聚类，而与枝手目瓜参科和沙子鸡科聚为一支，与形态学的分类不一致。[中国水产科学，2008，15(6)：935-942] 关键词 16S rRNA COI ：海参； 基因； 基因；序列比较；系统发育分析 中图分类号：Q959　　　文献标识码：A 　　　文章编号：1005-8737-(2008)06-0935-08 Echinodermata 1 海参隶属于棘皮动物门 ( )、海参 析。旨在：) 探讨来自不同地区刺参的 DNA 变异 纲 (Holothuroidea)。世界上已知海参种类大约有 水平，为分子标记技术应用于刺参鉴定提供依据； 1 2 1 400 种，约 160 个属 [ ] 。根据Pawson 等 [ ] 的分类， 2) 初步探讨刺参的系统分类地位，为刺参的系统发 海参纲包括 3 亚纲 6 目，即枝手海参亚纲，包括枝 育和遗传育种研究提供背景资料。 手目和指手目；楯手海参亚纲，包括楯手目和平足 1　材料与方法 目；无足海参亚纲，包括无足目和芋参目。温带区 海参资源呈单种性，分布于太平洋东西两岸，其中 1.1　实验材料 4 7 2 选用 种海参，共 只个体。其中鲜活刺参 只， 东岸以美国红海参 (Parastichopus californicus) 为 分别采自荣成和长岛，其余均是经处理过的干参