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第二章：蛋白质组学研究策略 与技术平台 纪 建 国 蛋白质工程与植物基因工程国家重点实验室 北京大学生命科学学院 主要内容： 1. 蛋白质组学研究技术 2. 蛋白质组学研究技术进展 3. 蛋白质组学在生物学研究中的应用 4. 蛋白质组学在医学研究中的应用 5. 蛋白质组学在药物研究中的应用 6. 蛋白质组学研究展望 7. 蛋白质组学研究的应用前景 8. 蛋白质组研究策略 一、蛋白质组学研究技术 1 蛋白质分离技术 双向凝胶电泳是蛋白质组学研究中蛋白质分离的核心技术 多维液相色谱 毛细管电泳 2 蛋白质鉴定技术 质谱技术是蛋白质组学研究中蛋白质鉴定的核心技术 Edman降解测序法 氨基酸组成分析法 3 蛋白质组生物信息分析技术 4 蛋白质组功能研究新技术及系统生物学研究 双 向 凝 胶 电 泳 基本原理: 第一向按蛋白质等电点的不同用等电聚焦分离；第二向 再按分子量的不同用SDS分离，从而把复杂的蛋白混合物中的 蛋白质在二维平面上分开 Patrick H. O’Farrell The pre-omics era: The early days of two-dimensional gels Proteomics, 2008, 8:DOI 10.1002/pmic.200800719 （共发表29篇论文，只有一篇Science，1985。 先进的技术方法必须结合生命科学重大问题 国家重大需求！！！） Separation Techniques Based on the Opposition of Two Counteracting Forces to Produce a Dynamic Equilibrium  Useful compounds, whether produced by chemical synthesis or biological synthesis, often need to be purified from complex mixtures. Biochemists and chemists thus recognize the need for efficient new preparative purification techniques for product recovery. Such fractionation techniques must have high capacity and high resolution. In a novel group of separation methods suited to the preparative fractionation of proteins, antibiotics, and other classes of compounds, the chromatographic flow of a solute down the column is opposed by solute electrophoresis in the opposite direction. Useful separation is achieved when these two counteracting forces drive the solute to a unique equilibrium position within the separation chamber. The properties of chromatographic matrices, for example, gel-permeation matrices of various porosities, provide a means of establishing the unique equilibrium points. Extraordinary resolution and capacity are attainable by these methods.  Ofarr