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一株多重耐药肺炎克雷伯菌KF3的质粒研究.pdf
ClainJMicmbiollmmunol,October2010.V01.30.No.10
.细菌学.
一株多重耐药肺炎克雷伯菌KF3的质粒研究
陆红云 张洪勤 姚晓鼎 王军荣 席亚丽 周明明 周铁丽 包其郁 李劲松
【摘要】 目的通过对肺炎克雷伯菌KF3质粒DNA全序列测定,从基因组水平研究质粒DNA
的结构、功能基因和与宿主菌耐药相关性。方法碱裂解法提取质粒DNA,构建质粒DNA文库并测
序。采用Phred/Phmp/Consed软件包进行序列拼接,Glimmer软件预测开放阅读框架(ORF)及功能分
析。结果构建包含3个质粒DNA的pUCl8文库和Fosmid文库,测序获得3个质粒全序列。功能
注释分析发现3个质粒均为可接合转移质粒,编码大量耐药相关基因。结论肺炎克雷伯菌KF3的
3个质粒都是町接合转移质粒,将耐药基因在细菌间进行水平转移,造成了耐药菌的播散。
【关键词】质粒;耐药基因;接合转移基因;肺炎克雷伯菌
of inKlebsiella K乃£U
Sequenceanalysisplasmid pneumoniaeHong-yun。,ZHANG舶增一qin,MD
Xiao—ding,WANGJun—rong,xlYo—h,zHoU Tie·li.BAO
Ming-ming,ZHOUQi-yu.LIJin-song.
Second in
Clinical,the
’Departmentof People’sHospitalTongxiang,Tongxiang314511,China
author:U Medical
correspond诫gj溉-song,DepartmentofBiology。WemhouCollege。Wenzhou325000。
China.Email:strongli72@sina.eom
To thestructuresofthe of KF3atthe
【Abstract】objec廿ve
study plasmidsKlebs拓姚p聊umoniae
level withwhole DNA thefunctionalcal-
genomemetagenomethmugth plasmidsequencing.toanalyze genes
fied andto the
correlationofresistanceand betweenthe andthe
byplasmid identify pathogenicity plasmids
hoststrains.MethodsThealkalinemethodwagusedtoextract constructedthesmall
lysis plasmids.We
insert andthe insertForsmid andusedthe
pUCl8library large library.sequencedPhred/Phrap/Consed
toassemblethese and a franle(ORFs)were
package sequencesgainedcompletesequence.111eopenreading
theGlimmersoftware We
and thefunctionsofthese sue.
p
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