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基于J2EE构架的药物与靶点综合数据库及其查询系统(DTDB)的设计与实现.pdf
2009年7月 四川大学学报(自然科学版) Jul.2009
ofSichuan ScieneeEdition) V01.46NO.4
第46卷第4期 Journal University(Natural
doi:103969/j.issn.0490—6756.2009.04.054
2
基于JEE构架的药物与靶点综合数据库
及其查询系统(DTDB)的设计与实现
3
,
陈庆一1,曹 毅 刘廷林2,石 兵 马玉刚
(1.四川大学生命科学学院四川省生物信息与代谢工程共享实验平台,成都610064,
2.四川大学生物治疗国家重点实验室,成都610065}
3.四川大学计算机学院,成都610065)
摘 要:介绍了收集、整理目前已发现的所有药物及其作用靶点的相关信息,并整合现代分子
生物、药物、化学等的最新进展,采用业界领先的Java的J2EE框架,建立一个综合的数据库系
统的过程.同时在该综合数据库系统的基础上,嵌入药物分子和靶点的对接技术,使得该系统
除用于一般的药物分子和靶点查询之外,还能实现基于分子反向对接的虚拟筛选和通过药物
分子寻找其作用的潜在蛋白靶点.
关键词:药物;靶点;数据库;J2EE
中图分类号:R914.2 文献标识码:A 文章编号:0490—6756(2009)04—1155.06
and ofa and database
Designimplementdrug target
on architecture
(DTDB)basedJ2EE
CHEN 3
Qin—H1,CAOYil,LIU
Ting—Lin2,SHIBin93,MAYu-Gang
(1.SichuanPublic PlatformofBioinformaticsandMetabolic
Experiment Engineering,
ofLife
Sciences,Sichuan 610064,China;
College University,Chengdu
StateLab,Sichuan 610065,China;
2.BiotherapyKey University,Chengdu
Science
3.ComputerCollege,SichuanUniversity,Chengdu610065,China)
Abstract:The describestheauthor an database
paperbriefly developedintegrative
alltheinformationof and availableand themost
throughcollecting drugstargetscurrently
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