基于集成分类器的凋谢蛋白亚细胞定位预测方法.pdfVIP

第 27卷 第 5期 计算机 与应用化学 Vo1．27，No．5 2010年 5月28日 ComputersandAppliedChemistry May，2010 基于集成分类器 的凋谢蛋 白亚细胞定位预测方法 李爱明，魏蓉 (河北理工大学理学院，河北 ，唐山，063009) 摘要：凋谢蛋白亚细胞定位预测是研究凋谢蛋 白生物功能的1种重要的方法，也是生物信息学研究的重要领域之 一 。 提高凋谢蛋白亚细胞定位预测模型准确性和实用性是该研究的重点。在本研究中，提出了以模糊 近邻分类 算法作为基础分类器的集成分类算法。以蛋 白质序列内不同间隔的二肽组成表示基本的蛋 白质序列的特征集合， 采用二进制粒子群算法作为特征选择方法提取能够有效的蛋白质序列特征。这些经过特征选择后的蛋白质序列特 征作为集成分类算法中每一个基础分类器的输入向量。经过在2个常用的数据集上使用Jackknife测试 ，本文算法 在CL317数据集上取得了91．5％的预测准确