汉滩病毒西安分离84FLi的M片段全基因序列测定及分析_医学论文.docVIP

汉滩病毒西安分离84FLi的M片段全基因序列测定及分析_医学论文 汉滩病毒西安分离84FLi的M片段全基因序列测定及分析_医学论文 作者：李新红　杨为松　杭长寿　白雪帆　马本江　黄长形　李光玉 【关键词】 汉滩病毒 关键词: 汉滩病毒84FLi株序列分析系统发生树 摘 要:目的 测定我国肾综合征出血热患者流产胎儿肝脏分离病毒84FLi株的全M片段基因序列，了解其分子基础. 方法 采用反转录-聚合酶链反应（RT-PCR），分节段扩增M基因片段的cDNA，直接用PCR产物或克隆入pMD18-T载体后进行测序. 结果 84FLi株的全M基因序列组成为:M片段基因共由3616个核苷酸组成，四种核苷酸的比例分别为A30.92%，C18.03%，G21.18%，T29.87%.GC含量为39.21%，AT含量为60.79%.最大开放读码框为41～3448，共编码1135个氨基酸.核苷酸序列同源性分析表明84FLi株与HTN型同源性高于与其他型汉坦病毒的同源性，其中与中国株的同源性较高，与HV114株的同源性为85.5%.与HTNV的国际标准毒株76-118的核苷酸同源性分别为84.0%，氨基酸的同源性为96.0%. 结论 84FLi株属于汉滩型病毒，并与分离自国内的汉滩病毒同源性较高. 　　Keywords:hantaan virusstrain84FLisequence analysisphylogenetic tree Abstract:AIM To study the complete M segment sequence of84FLi，a Hantaan virus isolated from a fetal liver in Xi’an and to explore its molecular characters.METHODS The cDNA of M segment was amplified fragment by fragment us-ing RT-PCR.The purified PCR products were sequenced di-rectly or cloned into pMD18-T vector and then sequenced.RESULTS The complete M segment of84FLi strain was composed of3616nucleotides with a single open reading frame，extending from41to3448encoding1135amino acids.Homology analysis showed that the homology of84FLi M segment nucleotide sequences with HTN isolates，especially Chinese isolates，was higher than that of other Hantavarises，for example，85.5%nucleotide sequences with HV114（iso-lated in China），while only84.0%with76～118（HTN for-eign standard strain）.The amino acid homology between the two strains was96.0%.CONCLUSION The results sug-gest that Strain84FLi is one of the Hantaan virus，which is highly related to other Chinese Hantaan virus isolates. 　　0 引言 　　汉坦病毒（hantavirus，HV）属于布尼亚病毒科汉坦病毒属，人类感染可导致两种严重的疾病:肾综合征出血热（hemorrhagic fever with renal syn-drome，HFRS）和汉坦病毒肺综合征（hantavirus pulmonary syndrome，HPS）.病毒有包膜，其基因组是一个单链含大（L）、中（M）和小（S）三个基因片段的负链RNA，编码的结构蛋白分别为L蛋白（即依赖RNA的RNA多聚酶）、包膜糖蛋白（G1，G2）和核衣壳蛋白（NP）［1，2］ .病毒的中和抗原位点、血凝抗原位点、型特异性位点和毒力位点等均位于包膜糖蛋白上，故测定M片段的核苷酸序列将有助于了解病毒致病性的分子基础［3-5］ ，同时M基因构建的系统发生树还可以用来做病毒分型.84FLi株是杨为松等于1984年从肾综合征出血热患者流