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ISSR分子标记技术在桃品种鉴定中的应用.pdf
ISSR 分子标记技术在桃品种鉴定中的应用
1 1 1 1 1* 1 1 2
孙淑霞 ,李靖 ,陈栋 ,谢红江 ,江国良 ,涂美艳 ,鲜小林 ,彭春华
(1.四川省农业科学院园艺研究所,四川成都,610066;2. 成都市龙泉驿区农发局,成都
市龙泉驿区 610100)
摘 要:桃品种分子鉴定是种质资源研究和新品种保护的基础。本研究利用ISSR标记对 28份桃种质进
行了品种鉴定及亲缘关系检测。结果发现:23 条 ISSR 引物共扩增出 188 条 DNA 片段,其中 96 条具有多态
性,多态性频率为 51.06%;每个 ISSR 引物可扩增出 6~13 条 DNA 片段,平均 8.17 条;材料间遗传相似系数
GS变幅为0.84~0.97,平均为0.92。ISSR标记分子聚类图直观反映了品种间的差异,揭示了多数来源地相
同的种质表现出较为密切的亲缘关系。在供试的 5 份材料鉴定出 9 条特异出现 DNA 片段,在 9 份材料中鉴
定出 11 条特异缺失 DNA 片段,其中红碧桃鉴定出特异出现和特异缺失两种 DNA 片段。这 20 条特异 DNA 片
段可转化为 SCAR 或 SSR 标记,用于对相应品种及杂交后代指纹鉴定。该研究结果对桃种质资源的保存和
利用,新品种的登记、注册及产权保护具有重要意义。
关键词: 桃; ISSR; 品种鉴定; 指纹图谱
桃[prunus persica(L.)Batseh.]属于蔷薇科(Rasaceae) 桃属(Prunus),原产于中国,具有丰
富的种质资源。桃为多年生作物,多采用嫁接繁殖,新老品种数量繁多,且不同地域经常交
换,极易造成同名异物及同物异名现象,仅依靠传统的形态特征很难识别,而 DNA 指纹图
谱能从本质上反映生物个体差异,具有高度个体特异性和稳定可靠性。高质量指纹图谱可作
为新品种登记、注册和产权保护的重要依据。
目前,利用分子标记对桃种质进行品种鉴定的研究还未见有报道,在其他果树上这方面
Martins (2008 )利用RAPD 和 SSR 标记对葡萄牙当地和引进的橄榄树
的研究也少之又少。
种质资源进行了遗传多样性及品种鉴定研究。Barysheba 等(2003 )通过对欧亚种一些葡萄
品种的 RFLP 研究,获得一系列可以作为品种鉴定基础的 DNA 位点。ISSR (inter-simple
sequence repeat)标记是基于简单序列而设计的寡核苷酸序列引物,是一种以 PCR 扩增为基础
的分子标记技术,谱带丰富,作为随机引物广泛应用于不同基因组序列的物种鉴定中。本研
究首次利用 ISSR 标记对来自国外和国内 28 份桃种质进行品种鉴定分析,以期为桃种质资
源的研究利用提供参考。
1 材料与方法
1.1 材料与 DNA 提取
供试材料达 60 余份,均来自于四川省农业科学院园艺研究所中江桃品种园,其中 28 份
用于品种鉴定分析,另外 30 余份用于对特殊条带检验。部分字母编号为国外引进或名称混
淆材料。基因组 DNA 的提取参照Doyle 等(1990)改良的 CTAB 法,并稍加改进。新鲜幼叶在
液氮研磨后将磨碎的材料移入 5mL 离心管中,加入 3 mL 65℃预热的 CTAB 提取液
[100mmol/L Tris-HCL,20mmol/L EDTA,1.4mol/L NaCl (M/V),2.5%CTAB (M/V), 2%PVP
(M/V), 2%(V/V)β-巯基乙醇(随用随加)] 。摇匀, 65℃水浴45min ,期间轻轻摇匀 3 次。加
233
入 2ml 酚:氯仿:异戊醇(25:24:1 ),上清液再加入等体积氯仿:异戊醇(24:1 ),得到的
DNA 用 TE 溶解后再重复以上步骤加以纯化。
1.2 引物筛选与 PCR 扩增
所用 ISSR 引物参照加拿大哥伦比亚大学 UBC 公司公布的第 9
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