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生物化学期末考试复习试题 蛋白质空间结构与功能的关系，试举一例说明。 答：体内蛋白质所具有的特定空间构象都与其特殊的生理功能有着密切的关系。例如角蛋白含有大量α-螺旋结构，与富含角蛋白组织的坚韧性并富有弹性直接相关；而丝心蛋白分子中含有大量β-折叠结构，致使蚕丝具有伸展和柔软的特性。以下以血红蛋白为例，阐述蛋白质空间结构和功能的关系： 血红蛋白（Hb）具有四个亚基组成的四级结构，每个亚基结构中间有一个疏水局部，可结合1个血红素并携带1分子氧，因此一分子Hb共结合4分子氧。成年人红细胞中的Hb主要由两条α肽链和两条β肽链（α2β2）组成，α链含141个氨基酸残基，β链含146个氨基酸残基。Hb亚基之间通过8对盐键，使四个亚基紧密结合而形成亲水的球状蛋白。 Hb与O2 结合的S型曲线提示Hb的4个亚基与4个O2结合时平衡常数并不相同，而是有4个不同的平衡常数。Hb最后一个亚基与O2结合时其平衡常数最大，从S型曲线的后半部呈直线上升可证明此点。根据S型曲线的特征可知，Hb中第一个亚基与O2结合以后，促进第二个及第三个亚基与O2的结合，当前三个亚基与O2结合后，又大大促进低四个亚基与O2结合，这种效应称为正协同效应。 根据Perutz等利用X线衍射技术分析Hb和氧合Hb结晶的三维结构图谱，提出了解释O2与Hb结合的正协同效应的理论。 未结合O2时，Hb的α1/β1和α2/β2呈对角排列，结构较为紧密，称为紧张态（T态），T态Hb与O2 的亲和力小。随着O2 的结合，4个亚基羧基末端之间的盐键断裂，其二级、三级和四级结构也发生变化，使α1/β1和α2/β2的长轴形成15°的夹角，结构显得相对松弛，称为松弛态（R态）。T态转变成R态是逐个结合O2而完成的。在脱氧Hb中，Fe2+半径比卟啉环中间的孔大，因此Fe2+ 高出卟啉环平面0.075nm，而靠近F8位组氨酸残基。当第1个O2与血红素Fe2+ 结合后，使Fe2+的半径变小，进入到卟啉环中间的小孔中，引起F肽段等一系列微小的移动，同时影响附近肽段的构象，造成两个α亚基间盐键断裂，使亚基间结合松弛，可促进第二个亚基与O2结合，依此方式可影响第三、四个亚基与O2结合，最后使四个亚基全处于R态。此种由一个氧分子与Hb亚基结合后引起亚基的构象变化，称为变构效应。小分子O2称为变构剂或效应剂，Hb则被称为变构蛋白。变构效应不仅发生与Hb与O2之间，一些酶与变构剂的结合，配体与受体结合也存在着变构效应，所以它具有普遍的生物学意义。 什么是蛋白质超二级结构，举例说明其扮演的角色。 答：在许多蛋白质分子中，可发现两个或两个以上具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个有规则的二级结构组合，被称为超二级结构。目前已知的二级结构组合形式有3种：αα，βαβ，ββ。研究α-螺旋之间、β-折叠之间以及α-螺旋与β-折叠之间相互作用的规律发现，主要由非极性氨基酸残基参与此类相互作用。而模体是具有特殊功能的超二级结构，它是由两个或三个具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个特殊的空间构象。一个模体总有其特征性的氨基酸序列，并发挥特殊的功能。一般而言，常见的模体可以有以下几种形式：α-螺旋-β转角（或环）-α-螺旋模体（常见于多种DNA结合蛋白质）；链-β转角-链模体（常见于反平行β-折叠的蛋白质）；链-β转角-α-螺旋-β转角-链模体（常见于多种α-螺旋/β-折叠蛋白质）。在这些模体中，β转角常为含3~4个氨基酸的片段；而环为较大的片段，常连接非规则的二级结构。 在许多钙结合蛋白分子中通常有一个结合钙离子的模体，它由α-螺旋-环-α螺旋三个肽段组成，在环中有几个恒定的亲水侧链，侧链末端的氧原子通过氢键而结合钙离子。近年发现的锌指结构也是一个常见的模体例子。此模体由一个α-螺旋和两个反平行的β-折叠三个肽段组成。它形似手指，具有结合锌离子功能。此模体的N-端有一对半胱氨酸残基，C-端有一对组氨酸残基，此四个残基在空间上形成一个洞穴，恰好容纳一个Zn2+。由于Zn2+可稳固模体中α-螺旋结构，致使此α-螺旋能镶嵌于DNA的大沟中，因此含锌指结构的蛋白质都能与DNA或RNA结合。可见模体的特征性空间构象是其特殊功能的结构基础。有些蛋白质的模体仅有几个氨基酸残基组成，例如纤连蛋白中能与其受体结合的肽段，只是RGD三肽。 蛋白质四级结构有何利处？举例说明。 答：在四级结构中，各亚基间的结合力主要是氢键和离子键。由2个亚基组成的蛋白质四级结构中，若亚基分子结构相同，称之为同二聚体，若亚基分子结构不相同，则称之为异二聚体，含有四级结构的蛋白质，单独的亚基一般没有生物学功能，只有完整的四级结构寡聚体才有生物学功能。 血红蛋白是由2个α亚基和2个β亚基组成的四聚体，α亚基和β亚基分别含有141个和146个氨基酸。两