C6%2f36浓核病毒结构研究.pdfVIP

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电子显微学报J.Chin.Elecu.Microsc.Soc 25(增刊):213—2142006年 213 C6/36浓核病毒的结构研究 程凌鹏1’2,陈森雄1,李志红1,周正洪3,张景强” (1.中山大学有害生物防治及资;馨利用国家重点实验室,广东广州510275;2.华南理工大学生物科学 of 与工程学院,广东广州510640;3.Department Pathology&LaboratoryMedicine,University ofTexasMedicalSchoolatHouston,Houston,TX77030,USA) 2002年我们从白纹伊蚊C6/36培养细胞中发现进行精修。以此找回被等价线算法所抛弃的许多病 和分离得到一株新的浓核病毒,命名为白纹伊蚊 毒颗粒,这样我们将5000多个病毒颗粒图像进行叠 C6/36cell 加,最终获得0.9nm分辨率的三维结构。获得的最 C6/36培养细胞浓核病毒(山如albop缸gs densovirus,简称C6/36DNV)。病毒的DNA长度为终结构显示C6/36DNV在五次轴顶有一突起,是由 4090 五个细长的管状结构并在一起,而形成的束结构,中 bp。衣壳由结构蛋白VPl和VlY2组成。电镜 细胞病理学的研究表明,C6/36DNV能抑制登革病 间有一个小的通道。这是细小病毒的一个显著特 毒在感染细胞中的复制,而登革病毒能促进C6/36征。在三重轴的顶点有一类三角形的凹陷,被三个 DNV的致病性。应用C6/36DNV感染白纹伊蚊1龄突起包围中间有一个类三角形的孔,其三边长的外 幼虫,死亡率可达97.46。用萤光定量PCR方法测侧各有一圆孔。而在二次轴顶点及附近有一类似 定受感染伊蚊体内病毒数量的变化,证明C6/36 “裂缝”。比较完整和空的病毒的结构,显示DNA与 DNV还能潜伏在幸存下来的成蚊体内并且能稳定 衣壳共有60个结合位点,分别对应60个占据非对 地遗传给下一代。通过实验,又证明在蚊子体内登 称单元的衣壳蛋白。这些结合位点恰好处于二次轴 DNV 革病毒能促进C6/36DNV的大量增殖而C6/36 通道下方,提示这些通道是DNA从衣壳中流出的通 反过来能抑制登革病毒的增殖。从而表明C6/36道。 DNV是一种极有前景的灭蚊和防治登革病毒的生 2生物信息学的比较 物药物。 为了探索病毒三维结构与其基因序列之间的联 1高分辨三维结构的测定 系,我们应用计算机生物结构信息处理技术把己获 C6/36 DNV衣壳由结构蛋白VPI和VP2组成。得的C3/36DNV的数据与其他的细小病毒进行比 VP2其实是VPl的一部份,仅比VPI的N端少了一较。比较的对象主要是:人类B19病毒(B19),犬细 段。C6/36DNV结构简单,适合于作为研究病毒的 结构与功能的一种模式生物。我们应用冷冻电镜单 经获得三维晶体结构研究的细小病毒,由于分辨率 颗粒技术,蛋白质结构预测以及克隆表达和重组等 不相同,我们分两个层次进行比较:一是三维结构的 技术对C6/36DNV的高分辨三维结构和重组机理进 分辨率为1.2nm下进行比较。在这个层次与B19, 行了研究。 CPV和GmDNV进行比较,它们的衣壳蛋白结构从 DNVProleinData 首先应用冷冻电镜单颗粒技术测定C6/36 Bank网络数据库下载,其编号分别为 的高分辨三维结构。计算机三维结构是通过基于二 十面体等价线方法的IMPS软件包获得。

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