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．14． 微生物生态学研究进展——第五届微生物生态学术研讨会论文集
利用鼠疫耶尔森氏菌全基因组DNA芯片
对比较基因组学、进化基因组学与
生态位适应的研究
周冬生·韩延平1 宋亚军1 童宗中3 裴德翠1戴二黑1张玲1
包静月3李敏2崔百忠2张秀清3王津1 郭兆彪1 祁芝珍2
王效义1 汪
金丽霞z翟俊辉1杜宗敏1 建3黄培堂·杨瑞馥1
(1军事医学科学院微生物流行病研究所，全军微生物检验研究中心，国家生物医学中心分析微生物实验室
北京100071；2青海省地方病防治研究所，西宁811602；3中国科学院北京基因组研究所，北京100101)
摘要；基于现有全基因组序列，研制了鼠疫耶尔森氏菌全基因组DNA芯片．进行了数十株
鼠疫耶尔森氏菌株和假结核耶尔森氏菌的比较基因组杂交，分析了各基因在不同菌株间的差异分
布，由芯片杂交结果圈定了靶标基因，扩大菌株范围进行了大规模PCR验证，得到如下结果：探明
了-各基因组岛在鼠疫菌和假结核菌间的差异分布．探究了鼠疫菌的起源进化；在基因组上鉴定了
数十个差异区段(DFR)，根据各茵株的DFR图谱，建立了鼠疫菌基因组分型系统；建立了各基因
组型别问的系统发育关系，揭示了鼠疫茵基因组的进化规律及其与鼠疫菌生态位适应和鼠疫疫源
地扩展之间的关系，探明了鼠疫菌在中国的演化规律。
美■词：鼠疫耶尔森氏菌DNA芯片比较基因组学进化基因组学
DNA of
Genome in
MicroarrayAnalysis Dynamics
Yersinia intoBacterialGenome
Pestis：Insights
MicroevolutionandNiche
Adaptation
2
ZHOUl HANl SONGl TONG PEll
Decui
DongshengYanpin Yajun Zongzhong
DAllErhei
ZHANGlBA03 L12MinCUl2 ZHANGl
Ling Jingyue Baizhong
WANGlGU01ZhaobiaoZhizhenLiXia
Xiuqing Jin Q12 JIN2 ZHAllJunhui
DUl WANGl WANG3HUANGl YANGlRuifu
Zongmin Xiaoyi Jian Peitang
(1Instituteof and of Medical
MierobiologyEpidemiology．AcademyMilitary Sciences，Beijing
100071}2InstituteforEndemicDiseasesPreventionand
Qinghai Control，Xining
811602I3 GenomicsInstitute．Chineseof 100101)
Beijing
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