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- 2017-08-20 发布于重庆
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使用 TANSFAC数据库查询特定转录因子已知的结合位点.doc
使用 TANSFAC数据库查询特定转录因子已知的结合位点
TANSFAC是德国生物工程研究所开发的真核生物基因调控转录因子数据库包括顺式、基因、转录因子、细胞来源、分类和调控位点核甘酸分布6个子库。 5.4版本收录有4774种转录因子蛋白信息,结合位点信息11537个,以及相关基因1928个,参考文献9095条,对于顺式元件的分析功能非常强大。现在的版本TANSFAC 6.0应该包含更多信息。
1.其主页:。
进入主页后先注册,登录。点击TANSFAC进入数据库。
2.点击SEARCH,进入SEARCH页后点击factor
3.选择factor name,输入待查转录因子名称,例如:sp1
4.点击人类的sp1
5.进入sp1的页面, 点击BS,点击sp1下游基因的GENE accession no,如G000193
BS条目解释为Binding SITE
G000193的页面
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