EST 在植物代谢研究中的应用.pdfVIP

( ) 2003 年 9 月 北京联合大学学报 自然科学版 Sep. 2003 ( ) 第 17 卷第 3 期总 53 期 Journal of Beijing Union University Natural Sciences Vol. 17 No. 3 Sum No. 53 EST 在植物代谢研究中的应用 1 2 2 裴凌鹏 ,李　伟 ,黄勤妮 ( 1 北京联合大学 应用文理学院 ,北京 　100083 ;2 首都师范大学 生物系 ,北京 　100037) ( ) [摘 　要] 　表达序列标签 EST 数据库作为一种重要的基因组数据库 , 已成为基因发现、基因表 达及重组蛋白表达等研究的有力的分子生物学工具。EST 已用于鉴定那些特定植物种类或组织 的编码特定代谢途径酶的cDNA ,并用于探讨解决植物代谢问题。 [ 关键词] 　EST; 克隆 ;植物代谢 ( ) [ 中图分类号] 　Q 503 　　[ 文献标识码] 　A 　　[ 文章编号] 2003 ( ) 　　EST expressed sequence tags 是 cDNA 克隆的末 却很少含有 ,若将有价值的基因转入作物中进行表 端序列 ,平均长度为 300～500 bp ,称为表达序列标 达则会产生很大的经济效益。 签 ,通常是从已有的 cDNA 文库中随机取出几百到 1 　脂肪酸修饰酶基因的鉴定 几千个克隆一次测序产生 ,一般使用载体多克隆位 点互补序列作为通用引物。一个 EST 代表生物体 从植物组织中获得具有特定代谢能力的大量 某种组织在某一时期的一个表达基因。EST 的数 cDNA 序列的第一个应用是分离蓖麻油酸生物合成 目可以提示它所代表的基因表达的拷贝数,一个基 酶基因 ,这一例子体现了 EST 在植物代谢研究应用 ( 因在组织中表达的次数越多其相应的 EST 也就越 的意义和原则。众所周知 ,蓖麻油酸 即 1 ,2 - 羟油 ) 多。GenBank 、EMBLEBI 、DDBJ 等数据库是常用的 酸 有许多工业用途 ,它在蓖麻子中大量存在而在 EST 或包括 EST 的DNA 数据库 ,专门收集和记录已 其他植物中含量却很少。尽管在从发育的种子中 有的 EST 数据资源 ,在 dbEST 中记录了每个 EST 序 分离出的微粒体部分中已研究过与蓖麻油酸合成 列的登记号、测序引物、碱基序列和 cDNA 文库的 相关的关键酶 ———蓖麻羟化酶的活性 ,但这种酶却 来源等详细的资料。 不稳定 ,而且对其进行成功纯化过程也难于操作。 目前,EST 主要用来寻找新的基因和了解基因