ImageJ软件在检验医学图像分析处理中的应用.docVIP

ImageJ软件在医学图像分析处理中的应用 ImageJ是一个用Java语言开发的图像处理和分析平台,具备多种图像处理和分析功能, 下载地址: http: / /rsb1info1nih1gov/ ij/download /win32 / ij1332setup1exe 。该软件是一个免费软件,支持插件技术,而且开放源代码。互联网上针对该软件的免费插件很多(下载地址: http: / / rsb1info1nih1gov/ ij/p lugins/index1html) 。一、软件准备下载并安装ImageJ: 得益于Java 的跨平台性优势,ImageJ可以运行在Linux、Mac OS和Windows等平台上,这也是该软件的一大优势,是其得以广泛应用的原因之一。、实验分析:分析电泳图谱: (1)启动ImageJ ,打开采集的图像。用方形图像选择工具在图像上圈定一个电泳图谱(注意要将各个条带都全部框住), 然后按1 键(相应的菜单操作为:Analyze→Gels→Select First Lane),标记和选定该电泳图谱。如果一幅图像上有多个电泳图谱,将鼠标放在该方框的中央,按住鼠标拖动方框(注意不要改变方框大小)将其放在下一个电泳图谱上,按2键(相应的菜单操作为: Analyze→Gels→Select Next Lane),分别标记和选定这些电泳图谱。(2)所有电泳图谱都标记完毕后,按3键(相应的菜单操作为:Analyze→Gels→Plot Lanes)生成所有选定电泳图谱的光密度分布曲线。用直线工具在每一条曲线上划一条基线,使得曲线上的每一个波峰都能与基线围成一个封闭区域。如果生成的曲线较多,可以用手形工具上下移动图像执行此操作。(3)选用魔术棒工具,在曲线上的每一个波峰的封闭区域内单击鼠标,程序自动计算该封闭区域的面积,一个曲线上的所有波峰的面积都计算完毕后执行Analyze →Gels→Label Peaks,程序自动计算每一波峰的面积百分比,并标记在曲线上。此值即为该电泳图谱上各个条带的含量百分比。(4)一个电泳图谱分析完毕后,Analyze→Gels→ResetCounter将计数器回零,重复第3步操作,分析下一个电泳图谱的光密度曲线。统计学处理:用Excel 2000进行t检验。 首先用image J来打开此western blot的图像选定并标记目的条带的区域读取目的区域的光密度得到目的区域的光密度将每个区域隔开读取光密度数据7. 将得到的数据输入excel 或spss里面进行统计处理.