古代DNA 技术及其在家养动物驯化历史研究中的应用.pdfVIP

2011 年 第 56 卷 第 7 期：511 ~ 516 《中国科学》杂志社 评 述 SCIENCE CHINA PRESS 古代DNA 技术及其在家养动物驯化历史研究中的应用 ① ②* 刘冉冉 , 李宁 ① 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 北京 100193; ② 中国农业大学农业生物技术国家重点实验室, 北京 100193 * 联系人, E-mail: ninglcau@ 2010-06-07 收稿, 2011-01-17 接受 国家重点基础研究发展计划资助项目(2006CB102100) 摘要 家养动物始终伴随着人类文明的发生、发展, 其起源和驯化历史一直备受关注. 而在其 关键词 近万年的演化历史中, 家养和野生群体间可能发生基因互渗及替代, 因此基于现代物种 DNA 古代DNA 信息进行的历史推断可能存在偏差. 近年来, 古代生物遗骸中的DNA (古代DNA)获取技术日 家养动物 益成熟, 为这类研究开辟了新的途径. 本文总结了近年来古代 DNA 技术研究进展, 点评了古 驯化历史 代生物遗骸DNA 的获取和鉴别方法、古代DNA 提取、扩增及测序技术的革新. 最后, 本文综 述了古代DNA 技术在猪、马、羊、狗等主要家养动物驯化历史研究中的应用进展, 为该技术 的进一步发展及应用提供有益的参考. 驯化是指人类培育野生动物, 使其野性逐渐改 研究, 以克服利用现代DNA 信息推断古代历史产生 变, 成为对人类有用的家养动物的过程. 家养动物 的偏差. 在整个社会发展史中, 都为人类提供着稳定的食物 古DNA (ancientDNA, aDNA)是从死亡后的生物 来源, 在各种环境和生产系统中支撑着畜牧生产的 遗体和遗迹中得到的 DNA, 包括博物馆标本、古代 持续发展[1,2]. 开展对家养动物起源的时间、地点和驯 生物尸体及存在于古代动植物化石中的 DNA. 由于 化过程的研究, 一方面, 有助于对家养动物自身遗传 年代久远, 在内外环境的影响下, 古 DNA 具有数量 多样性形成过程的了解, 为遗传资源多样性的可持 少、片段短、受损伤等特点[5,6]. 本文将从古代 DNA 续性保护和利用提供理论依据; 另一方面, 可以为人 的提取、扩增和鉴别方法、古代DNA 技术的近期发 类文明形成历史的研究提供可参考的信息. 展及古代DNA 技术在家养动物驯化历史研究中的应 至今为止, 考古学研究积累和分子遗传学的应 用等方面做一综述. 用, 使我们对许多家养动物起源和驯化历史有了初 步的认识. 例如, 已经确定了多个家畜物种的多样性 1 古代DNA 的获取和鉴别 中心或起源地, 包括西南亚新月沃土(Fertile Cres- 1.1 古代样本 cent)(牛、绵羊、山羊和猪的起源地) 、中国东部(猪、 鸡、沼泽水牛) 、东南亚(鸡、巴厘牛) 等[ 3 ] . 然而, 目前, 保存下来的绝大多数古代材料, 都已受到 驯化历史是一个过程, 一些从现代家畜的遗传信息 了不同程度的污染. 一般认为, 牙齿优于骨骼, 密质 看到的独立驯化事件, 可能只代表少数驯化个体 骨优于松质骨, 骨骼组织优于软组织. 去除古代材料 迁移到一个新的地区, 还有可能这些新迁入家畜的 污染的方法包括: ( ⅰ) 去除已被污染的材料表面; 遗传信息后来又被本地野生