微生物资源的生物勘探.pdfVIP

第31卷第8期 热带作物学报 V01．3INo．8 CHINESE TROPICALCROPS 2010年8月 JOURNALOF Aug．2010 微生物资源的生物勘探 谢晴宜．洪 葵 中国热带农业科学院热带生物技术研究所．海南海口 571101 摘要从传统资源研究方法和“meta一技术”两方面阐述了微生物勘探的必要性．介绍微生物勘探的主要内容与 研究方法，讨论微生物勘探对微生物资源研究的意义与价值及其发展趋势。 关键词 生物勘探；未培养微生物；微生物资源 doi10．3969／j．issn．1000-2561．2010．08．034 中图分类号Q93 微生物资源的收集与开发随着各种新疾病的出现。已有药物的耐药性问题、环境与能源问题等重新 成为微生物学研究领域的热点。人类未涉足的环境如深海、极地等成为新资源竞相开发的目标。与此同 时，分子生物学、生物信息学技术及各种组学技术的发展与应用不仅为微生物资源研究提供了新的技术 butnoncuhurable microorganisms)”、“可见不可培养(viable uncultured 和储存也需要而且可以进行勘探。尤其是对热带地区的微生物[21、极端微生物[31、特殊环境微生物【4】和未能 培养微生物[5-61等，对目标资源预先选择，并进行生物勘探可以有效、理性地获得资源，避免盲目和重复。 1 生物勘探的概念与应用 生物勘探(bioprospecting)是生物多样性勘测的英文缩写(biodiversity 物、动植物等)是否具有或潜在具有工业、农业、医药、能源、食品和环境治理等方面的价值【27l。而对于 针对其种群、基因以及代谢产物，是否存在及其应用价值(应用价值或理论价值)的探测。目前．微生物 勘探的主要研究内容包括：(1)探测微生物的种类或遗传的多样性，涉及微生物种群生态、分类鉴定、监 测等；(2)探测(并研究)微生物是否具有或潜在具有有价值的酶、生物活性代谢物以及其他特性；(3)探测 环境中微生物的繁殖能力；(4)探测微生物在实验室培养、保存以及操作的可能性【l】。 2生物勘探应用于常规微生物资源研究 依赖培养的常规微生物资源研究主要包括采样、分离、活性评价、鉴定及保藏等过程。这些技术很 可能意外发现微生物资源的某些应用价值(或潜力)，如产生某种抗生素、抗肿瘤物质等，但是这类新发 现不但耗时耗力、几率非常低而且重现率非常高。因此，为了避免盲目，提高效率，微生物资源研究首 先要解决从哪里分离和如何分离两个老问题【n。经验上，这两个问题常取决于分离目的。如欲分离多环芳 香烃降解菌可从多环芳香烃污染的环境中采样分离；欲分离淀粉酶产生菌可从淀粉厂废水等环境分离目 的菌株；而欲新活性次级代谢产物生产菌．则可在人类活动影响小的深海、极地、极端环境、红树林、 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(No．ITBBZD0753)资助。 第一作者简介：谢晴宜，男，1978年生，硕士，助理研究员。主要从事微生物学研究。E-mail：xie-qy@sohu．eoni。 }通讯作者，洪葵，E-mail：k1022@163Inet。 收稿日期：2010-08-01修回日期：2010--09-01 万方数据 8期 谢晴宜等：微生物资源的生物勘探 自然保护区等新环境中获取的新菌、新代谢产物。尽管这些经验能找到一些目的菌株。但是常常由于环 境背景了解并不多．尤其是微生物的类群及分布信息缺乏，采样和分离通常是随机挑选样品或挑选代表 样品(其中随机样品比代表性样品具更小的偏差嘲)，因此，采样和分离时通常存在随机和主观臆断等问题。 而这些是微生物资源研究中存在盲目、效率低和重现率高的重要因素。 勘探技术(如特异引物PCR)应用于常规微生物资源研究(尤其是缺乏资料背景缺乏的环境)时。有助于 clade的成员，他们首 减少或克服这些不利因素的影响。如Kum