收集的晶体解析问题的资料.docVIP

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收集的晶体解析问题的资料 1.? ? 通常,H原子的处理方法作者要给出 (1)一般通过理论加H,其温度因子为固定值,可通过INS等文件查看 (2) 水分子上H原子可通过Fourier syntheses得到 (3)检查理论加上的H原子是否正确,主要看H原子的方向。若不正确则删去再通过Fourier syntheses合成得到 (4) 检查H原子的键长、键角、温度因子等参数是否正常。通过检查分子间或分子内的H键是否合理最易看出H键的合理性 (5) 技巧:有时通过Fourier syntheses得到的H原子是正确的,可一计算其温度因子等参就变得不正常,则可以固定其参数后再精修(如在INS中的该H原子前用afix 1,其后加afix 0) (6)各位来说说方法与心得? 2.? ? 胡老师,下面的问题怎么解决啊?谢谢您。 220_ALERT_2_B Large Non-Solvent  C   Ueq(max)/Ueq(min) ... 3.70 Ratio   222_ALERT_3_B Large Non-Solvent  H   Ueq(max)/Ueq(min) ...    4.97 Ratio 342_ALERT_3_B Low Bond Precision on C-C bonds (x 1000) Ang ...     49 B 级提示当然得重视了。建议你先把 H撤消,精修到 C的热椭球不太变形和键长趋正常。 如做不到就要看空间群?衍射点变量比太小?以至追查到原始数据的录取参数和处理等。 这些粗略意见仅供参考,如何? 3.? ? 在XP中画图时,只有一部分,想长出另外的对称部分。我是envi完了,然后sgen长出来的,可是和symm显示的对称信息不一样。比如:我根据envi的结果用sgen O1 4555得到的是O1A而不是O1D,这跟文献中标注的不一样啊,怎么统一呢?很困扰,忘达人指教。 xp里是按顺序编号的,第一个sgen出的的统一为A,依次标号。你如果想一开始就统一D的话,重新name一下 4.? ? 高氯酸根怎么精修呀?我用的SHETXL6.1版的,最好告诉我怎么用其中的XSHELL来做,我觉得他好用! Method DFIX(1 Dfix 1.42 0.02 Cl1 O1 Cl1 O2 Cl1 O3 Cl1 O4      Dfix 1.42 0.02 O1 O2 O1 O3 O1 O4 O2 O3 O2 O4 O3 O4 SADI(Method 2 Sadi 0.01 Cl1 O1 Cl1 O2 Cl1 O3 Cl1 O4 Sadi 0.01 O1 O2 O1 O3 O1 O4 O2 O3 O2 O4 O3 O4 5. 晶体的无序是怎么造成的呀,是晶体培养的问题吗? 如果无序太多,在解单晶的时候怎么办?我指的是很多的点,没有结构,他们的峰值都大于了0.5 大于0.5没什么的,解完后都在1以下就可以了。特殊的比较大的在重原子附近也没有关系 5.? ? 比较确切的定义是单胞中你测定的或你设想的“化学式”的数目。 在分子晶体中,Z 是分子数,在其它各类晶体中则为化学式个数。 例如有机物一般是分子数目,离子晶体像 NaCL只好说化学式为4。 晶体结构常有无序和缺位等,但给出非化学计量式后Z都是确定的。 Z 的数字决定于你的化学式。三斜晶系的 P-1空间群的 Z多为 2。由于双聚等原因如将双聚体写成你的化学式,那么 Z就变为 1了。但是就拿这个三斜晶系来说,出现 Z为 4或 6的情况也是可能的。 这时分子形成双聚或者三聚,而你指定的分子式只是个单体罢了。测定结构初期得到单胞以后,往往希望知道单胞中有几个分子,如你知道了或提出了化学式,从我们介绍的范氏半径或原字体积即可毛估这个为整数的 Z了,不必测密度就知道 Z是很有意义的,因分子式有误 Z将不会合理,你不愿试一试? 6.? ? 其实现在水簇或者各种氢键越来越受到重视。但是给水加氢总是遇到很多麻烦,大家都希望能有一些实际可以用的经验来指导一下大家。您能给我们一些建议吗?有时候键长不合理(但是又没有其他合适的参峰),键角合理,您说这样如何加氢? 我仔细浏览了论坛的一些文章,您能给这些经验做一个评价吗?哪位大侠清楚DFIX和AFIX的用法及格式,请详细指点一下。Thanks a lot还有,差值加氢的时候如果找不到q,可以用cent产生个点,然后命名为氢吗?? 把O原子改成C原子,然后再看Q有没有了;如果没有放大Q值到100,不行放大到500个Q值我想你会加上去的!固定H的温度因子为母原子的1.5倍,然后再把C改成O,计算,大功告成  我非常关心这两条经验。麻烦您! 从这个贴子了解到大家对 H的指定问题非常热中,只好再谈谈我的看法仅供大家参考了。 我曾表白原则上

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