马尔柯夫及隐马尔柯夫模型 DNA 序列分析.pdfVIP

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2017-08-16 发布于江西
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马尔柯夫及隐马尔柯夫模型 DNA 序列分析.pdf

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7.91/7.36/BE.49 0 第四讲 2004.3.4 马尔柯夫及隐马尔柯夫模型 DNA 序列分析 Chris Burge 课程结课时主题模型结相关加权矩完全独立阵模型隐马尔柯局部相关夫模型能量模型，共非局部相关变模型 DNA 的马尔柯夫及隐马尔柯夫模型  剪接位点的马尔柯夫模型  隐马尔柯夫模型 —— 在头巾下观看  威特比(Viterbi) 演算法  真实世界中的隐马尔柯夫模型 DNA 基序建及发现简介  剪接位点的加权矩阵模型（WMMs ） 模体 (motif) 代表的信息 模的寻找或发现问题 吉布斯采样法 模建——加权矩阵之上 DNA 、 RNA 基序包含的信息信息熵（shannon entropy ）信息/ 位置 m 随机序列中每 2 个碱基将产生一个包含 m 比特信息的模变量对发现基序的影响 L ＝序列平均长度 N ＝序列编码 I ＝模包含的信息 W ＝模宽度怎样识别 5’ss RNA 热力学 I 螺旋构型自由能来自于：碱基配对：碱基堆积： Doug Turner’s 能量规则： RNA 热力学