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基因组学4.pdf
4.1 DNA测序的方法
第4章 基因组测序
化学降解法测序(Chemical degradation
4.1 DNA测序的方法 method )
链终止法测序(The chain termination
4.2 DNA序列的组装 method )
4.3 基因组测序进展 自动化测序(Automatic sequencing )
焦磷酸测序(Pyrosequencing )
4.4 EST测序
芯片测序
几种最新的测序方法
1 2
化学降解法测序步骤
化学降解法测序
双链 降解
在选定的核苷酸碱基中引入化学集团,
再用化合物处理,使DNA分子在被修饰的 单链
位置降解,根据片段的大小依次读取序列。 电泳分离
末端标记
读序列
核苷酸修饰
3 4
Maxam-Gilbert法所用的化学修饰技术 化学法测序
碱基 特异修饰方法
pH 8.0,用硫酸二甲酯对N7进行甲基化,使C8-C9键对 硫酸二甲酯
G
碱基裂解有特殊敏感性
pH 8.0,哌啶甲酸可使嘌呤环的N原子化,从而导致脱
A+G
嘌呤,并因此消弱腺嘌呤和鸟嘌呤的糖苷键
C+T 肼可打开嘧啶环,后者重新环化成五元环后易于除去
C 在1.5 mol/L NaCl存在时,可用肼除去胞嘧啶
5 6
1
序列的 链终止法测序
读取
以单链DNA为模板,设计与之配对的引物,
在DNA聚合酶的作用下合成新链,其中一种为
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