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DNAStar中文使用说明书 编者：宋晨 一、EditSeq 2 三、MapDraw 23 四、MegAlign 32 五、PrimerSelect 42 六、Protean 54 七、SeqMan II 开始64 生物秀-专心做生物！ 1 一、EditSeq 打开已有序列 我 们 从 用 苹 果 计 算 机 打 开 “TETHIS21MA ” 和 用 Windows 打 开 “tethis21.seq”开始。 假设序列的末尾有载体序列污染。我们在用 EditSeq打开序列的同时， 用 Set Ends 命令去除 5’和 3’污染序列。 从文件菜单（FILE MENU），选择 Open。 打开文件夹 “Demo Sequences”单击选定序列 “TETHIS21”。 单击位于对话框右下角的 Set Ends 按 钮。Set Ends 被打开（如右）。 在 5’框和 3’框中键入 50 和 850，点 击 OK。单击 Open 打开序列。 当EditSeq 窗口打开时，序列长度显示在右上角。通过 “setting ends,” 现在你只有最初序列中的 801 bp 的片段。Set Ends 选择在全部 Lasergene 应用程序中都可以使用。 2 寻找开放读框 在这入门的一部分中，我们将确定序列中最大的 ORF，并翻译它。 从 SEARCH MENU 找到 ORF，点 击打开会出现右边的对话框。 单击 Find Next 寻找第一个 ORF 的位置。 继续点击 Find Next 直到你把 ORF 的位置选定在位置 183-455。ORF 的坐标会出现在 EditSeq 窗口的顶端附近。 DNA 序列翻译 这一节中我们介绍如何翻译我们的 ORF，不过任何序列中的读框内部分 都可以用下面的方法进行翻译。如果你的选择是在三联码的读框内，三 联码指示棒显示为实心黑线 （如左图）。如果 3 你的选择是不在三联码的读框内，左边的箭头和右面的箭头显示向左或 向右移动一个 bp，以使所选序列成为三的倍数。 选定 ORF， 从 GOODIES MENU 菜单中选择 翻 译 （Translate ）。 翻译的蛋白 质序 列出现在一 个新的未命 名 窗 口中（如右 图）。它是使用标准的遗传密码翻译的。 4 使用其它遗传密码 根据你的序列的来源，你可以选择使用非标准的遗传密码进行翻译等操 作。在这节中，我们将标准的遗传密码转换成 Ciliate Macronuclear 密码 。 从 GOODIES MENU 菜单选择 Genetic Codes 打开，子菜单显示如左。 单击 “Ciliate Macronuclear”就实现 了