2010-2013年成都市肠道病毒71型基因进化分析.pdfVIP

现代预防医学 2014年第41卷第 2l期 ModernPreventiveMedicine，2014，Vo1．41，NO．21 · 实验技术及其应用 · 2010—2013年成都市肠道病毒71型基因进化分析 陈恒，杨才彬，黄韦唯，张晓春，黄薇，孟建彤 成都市疾病预防控制中心，四川成都 610041 摘要 ：目的 了解成都市 2010—2013年肠道病毒 71型 VP1基因变异情况 ，为疾病防控提供依据。方法 选取 2010—2013年 (上)荧光PCR检测为EV71阳性标本，扩增测序其VP1全长，构建进化树并进行相关生物信息学分 析。结果 25份标本基因亚型均为c4亚型，与阜阳株差异不大，核苷酸同源性 82．72％～100％，氨基酸同源性为 96．29％一100％，氨基酸变异位点 11个。结论 成都市2010—2013年 (上)肠道病毒71型变异不明显，但需关注关 键氨基酸突变位点及其可能带来的防控挑战。 关键词：人肠道病毒7l型；进化分析 中图分类号：R183．3+3 文献标志码：A 文章编号：1003—8507(2014)21—3944—03 Phylogeneticanalysisofenterovirus71isolatesinChengduduring2010to 2013 CHENHeng，YANGCai-bin，HUANGWei—wei，ZHANGXiao—chun，HUANGWei，MENGJian—tong． ChengduMunicipalCenterforDiseaseControlandPrevention,Chengdu,Scihuna 610041，China Abstract：ObjectiveTounderstandthevariationinVP1geneofenterovirus71(EV71)isolatesinChengduduring2010to2013 (firsthalfoftheye andprovidescientificevidencesforthepreventionandcontrolofdisease．MethodsIntotalof25positive samplesofEV71wereselectednadma plified．thenVP1genewassequencedandanalyzed．ResultsAllthe25samplesbelongedto C4subtype，wiht littledifferencefrom Fuyangisolate．ThenucleotidehomologyofVPIgenesma ongthe25strainswere82．72％ 一 100％．and96．29％-100％ ofhtema inoacidwiht 11mutationalsites．ConclusionThereisnoobviousmutationofVP1inEV71 inChengdududng2010to2013(firsthalfofhteyear)．However,thecriticalaminoacidmutationsandthepossiblechallengesin diseasepreventionandcontrolshouldbeconcernedabout． Keywords：Enterovirus71；Phylogeneticnaalysis 人肠道病毒71型 HumanEnterovirus71，EV71) 告病例 7470例，死亡23例。当年卫生部将手足 口 是小RNA病毒科肠道病毒属A组成员，是一种高度 病列入 1丙类传染病管理 ，但此后其发病率仍逐年 嗜神经肠道病毒。随着脊灰病毒在全球很多地区宣 上升，居丙类传染病首位。2009—2011年我国累计 布被消灭，EV71已被认为是最重要的热带嗜神经病 报告手足 口病 4549877例 ，死亡 1767例，重症 毒。EV71与 CoxA16 (CoxasckievirusA16