黑腹果蝇热激蛋白基因家族的生物信息学分析#39;.pdfVIP

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  • 2017-10-19 发布于北京
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黑腹果蝇热激蛋白基因家族的生物信息学分析#39;.pdf

! #$$ 年% 月 重庆师范大学学报(自然科学版) ’( #$$ 第) 卷 第* 期 +,-./’0 ,1 23,/456/4 7,.8’0 9/6:;.6=((7’=-.’0 ?6;/?; ) @,0A ) 7,A * 动物科学 BCD :27ED :%#F $$G%H 7A #$$#%$GA $#$*A $IJ 黑腹果蝇热激蛋白基因家族的生物信息学分析! ! ! 牟国鹏,陈! 斌,何正波 (重庆师范大学 生命科学学院 昆虫与分子生物学研究所 活性物质生物技术教育部工程研究中心 重庆市动物生物学重点实验室,重庆J###JI ) 摘要:热激蛋白是细胞或生物体受到热激后新合成的一类遗传上高度保守的蛋白,在生物体中普遍存在,在细胞生 长、发育、分化、基因转录等功能方面发挥重要的作用。本研究利用生物信息学方法首次对黑腹果蝇( !#$#% ’() *+(, )-#.)$/+ )全部热激蛋白进行分析。结果表明,黑腹果蝇热激蛋白共有 KL2 (KLM# )、KLN (KLI# )、B7N+ (KLJ# )、KLO (小分子 KL )、KLB (KLG# )、22P (PQ62 )等 G 个基因家族,不存在 KLR (KL$# )和 KLK (KL$$# )家族,共有*% 个基因,新发现I 个基因,命名为01234% 、01233 、01233* 、!5464I 、!5464) 、012!% 和 01273$。染色体定位表明,黑腹果蝇热激蛋白主要分布在S 、*S 、Q、*Q 和T 上。序列比对分析发现,黑腹果蝇热 激蛋白家族序列高度保守。进化分析表明,他们有共同的祖先,可分为G 个基因家族。 关键词:黑腹果蝇;热激蛋白;生物信息学;系统发育 中图分类号: U)$$A J ;UMG* 文献标识码:N! ! ! 文章编号:$GIF GGM*(#$$)#*F ##$#F #) ! ! 热激蛋白(K;’= 3,?V W.,=;6/ ,KL )是细胞或 族的第一个成员是在果蝇中发现的,位于胞浆中,其 生物体在一定时间内受高温热激或其它应激原作用 基因位于染色体*S 。KLI# 家族包括诱导性成员 下诱导新合成或含量增加的一类蛋白质。KL 在 012G) 、012I# ,分布在果蝇的胞浆和内质网中,有两 分子进化上高度保守,并广泛分布于微生物、植物、 个主要的结构域,7F端高度保守的NPL’; 功能域和 动物等各种生物体内,KL 在细胞生长、发育、分 2F端区域。KLG# 家族,包括 J 个基因012G#4 、 化、基因转录等功能方面发挥重要的作用[$F ]。近年 012G#3 、012G# 7 和 012G#! 。KLJ# 家族在野生 [I ] 来的研究表明KL 还参与某些病毒蛋白的成熟。 型果蝇 中不存在 。小分子 KL 家族包括 自$M) 年在美国冷泉港召开第一届KL 的国际会 012 、012* 、012G 和012I 。012 分布在线 议后,对 粒体基质内, KL 的研究蓬勃发展。中国对KL 的研 012I 分布在核内,012G 、012* 分 [)FM ] 究始于# 世纪)# 年代中期,研究对象以人类、哺乳 布在基质内 。目前,对于黑腹果蝇(!#$#%

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