鸡不同世代群体有效规模估算.pdfVIP

592 第十一次全国畜禽遗传标记研讨会论文集 鸡不同世代群体有效规模的估算古 饶友生1’2，夏梦娜1，沈栩1，张细权1 (1．华南农业大学动物科学学院，广州，510642； 2．江西教育学院生物技术研究所，南昌，330029) Fowl， 了36个SNP标记．通过多态性检验，最终选取了多态性丰富的21个位点在红色原鸡(Red Jungle silk Recessive RIF)、丝羽乌骨鸡(TaiheChicken，TS)，隐性白洛克鸡(White Rock，WRR)三个群体中进 行基因型定型．以，为统计量，估算了三个群体标记对之间的连锁不平衡值．相关性检验表明，红色原 步递减；隐性白洛克鸡(，卸．2356，R2=0．4217)虽未i拉0显著水平，但也表现出逐步递减的趋势，其， 总变异方差的42％是由传递距离引起的．研究结果和Sved方程拟合状况良好．根据Sved方程，估算了 size 鸡不同世代sh0帅rlong-term)的群体有效规模大小(effectiveofpopulation，M)．在鸡驯养的较早 期阶段(颅O)，各品种的群体有效规模均在2500以上；在鸡驯养的较晚期阶段(因92)，各品种的群 体有效规模渐趋稳定，含量约在600-800之间．如果本研究反映了鸡三个品种遗传结构的—般I陛，那么 该研究对于鸡各品种特别是丝羽乌骨鸡的原位保存有重要的指导意义． 关键词：红色原鸡丝羽乌骨鸡隐性白洛克鸡连锁不平衡群体有效规模 sizeof 群体有效规模(effective populalion，越)是指与实际群体有相同基因频率方差或相同杂合度 衰减率的理想群体的含量。群体有效规模的估算是群体遗传学研究的—个重要内容。在突变—漂变平衡 条件下(mutation-driftmodel)，如果所研究的座位是中性位点(neutralloci)，而且其重组率 equilibrium (或遗传距离)是已知的，那么使用连锁不平衡(1inkage 进行群体有效规模的估算(short-orlong-term 效规模估算时，其准确度主要依赖于LD估计的准确度。 silk RecessiveRock， 原鸡(Red Fowl，RJF)、丝羽乌骨鸡(TaiheChicken，TS)、隐性白洛克鸡．,(White Jungle WRR)的连锁不平衡模式。通过连锁不平 衡估算了三个群体不同世代的群体有效规模大小。本研究旨在对三个品种特别是丝羽乌骨鸡的原位保存 提供理论上的指导。 1．材料与方法 1．1实验材料 Recessive 本研究使用的隐性白洛克鸡(White 集团南方育种公司(随机抽样)；丝羽乌骨鸡KraiheSilkie，1．s)血样(共89个个体)采自江西省泰和县(随 机抽样)；红色原鸡(Red Fowl，RJF)血样(共33个个体)采自广西灵山县(野外捕捉)。血样 Jungle 经2％EDTA抗凝，使用苯酚．氯仿法从抗凝全血中抽提基因组DNA，10倍稀释后作为PCR反应的摸板。 1．2SNP的筛选 I ‘国家重点基础研究发展规划(973 I No．1 Animal Bulletin (October2008)V01．I Biotcchnology 利用鸡的dbSNP数据库筛选SNP。根据物理距离均衡筛选。选定某个位点后，可同时获得包含该 经过多态