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第四届全国环境化学学术大会论文集(上册)
苯砜基乙酸酯类化合物毒性的比较分子力场分析
杨伟华比;冯长君1;于红霞2
(1.徐州师范大学化学化工学院:2.南京大学环境学院污染控制与资源化研究国家重点实验室)
摘要用比较分子力场分析(CoMFA)方法研究了20种苯砜基乙酸酯类化合物对大型蚤和发光菌的急性毒
性效应。得出了最佳网格:x:一13~11,y:一12~11.z:一9~14.以此网格分析的化合物对大型蚤的急性毒
性的交叉验证系数q2值为0.581,非交叉验证系数铲值为0.989,立体场贡献为0.601,静电场贡献为0.399。
化合物对发光菌的急性毒性的q2-:0.660,Rz:=o.991,立体场贡献为0.559,静电场贡献为0.441.分析得出:
对化合物活性的影响立体效应起主要作用,结合等值面图,对该类化合物的合成及预测活性具有一定的指
导意义。
关键词苯砜基乙酸酯;大型蚤;发光菌;比较分子力场分析;三维定量结构活性相关
O引言
本文将比较分子力场分析(Co盯A)方法应用于20种苯砜基乙酸酯类化合物对大型蚤u1
和发光菌拉1的急性毒性效应研究,讨论了其三维立体空间结构与急性毒性效应的关系。
1研究方法
1.1CoMFA的原理
3D_QSAR研究中的比较分子力场分析的基本假设是:在分子水平上.,影响生物活性的相
互作用主要不是经典的共价作用,而是静电相互作用、疏水作用、va.r]derWaals力等非共
价键起作用。这种作用是通过探针原子在三维坐标系中进行的,由所得数据用偏最tJ、--乘法
(PLS)等统计方法进行相关性分析,并且通过交叉验证得到预测模型。
1.2活性构象确定及相关分子三维结构模建
本文研究的化合物的结构见图1。构效关系计算由Tripos公司的SYBYL7.0软件相应模
块支持。对结构A(见图2)进行模拟退火后得分子的最低能构象。对所获得的最低能构象
标题化合物的三维结构都以此活性构象为模板,取代相应的原子和基团,以分子力学程序
Minimize优化后得到。
1.3分子叠合
分子,采用结构图上的1-13号原子为叠合位点,采用AlignDatabase,将其余的化合物与
模板分子进行叠合。
图1.化合物的基本结构 图2.结构A
1.4 CoMFA分析
CoMFA采用偏最4,-乘法(PLS)对分子周围分布的势场值与其生物活性进行回归分析。
285
赫叫川午…蚪境化学宁木l盘设立雀({册
先川蹙义蝣I#方法抽法¨00)柬确定蛀挂土成分数和交义验证州¨系数q‘值.然后州非
交卫验证往PIS同归分折活性与宜义蝙证所确定的t成分数+得非奎叉验证脾I归系数旷值。
2结果与讨论
2 1 OoMFA结果
我们的研究取定步长为2A,j{史改刚辑大小柬进行研宄。树“jj,蛙佳同格㈨ l弘
11.y—i2一J1,z:9~14。咀此网梏分析的20种标题化台物对大型虽的急性毒性的交叉
989,p-188
鸵证系数q‘=058l,最佳纽分数n=6.非受叉验l正系数K‘0 137.标准偏筹
s=0
03I,立体场贡献为0601,静fU场贞献为0399.咀同列格分}』『的诜类他合物对发光
萌的急性毒性的q。0660,n7,R-099I.F=J98253,sO030.立体场贡献为0559.静
电场贡献为0州1。一般认为f大于05时,锡到的横型其有可信的项测能力“.网i『口我们
}^建的模型具有可信的预测能力。
2 2分子场等值面图
立体场等值面圈中,越灶接近绿包区域的取代基体积越^.而接近黄色睡域的体积越小.
别对活性越有利。由图3(a)可咀营出在如、R,、R。蕈团附近有大片绿色区域,表明在此
区域增大取代基体积将增加标题化台物的毒陛,删I 5号分子的如、飓基团依次增大.分
f的毒性依次增强。4、6、10号分子的R,基团依次增大,分子的毒性依次增强。而在飓基
团的苯基上有一黄色区域,表明在该苯基上再增加取代基.化合物的毒性反而会降低。
静电场等值面图中,则是越接近端色区域的取代基越足正电性.而接近红色区域的取代
基越是负电性.则对活性越有利。f自圈3(bj可见.在‰基团附近
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