MPVA软件设计及其在乳房炎易感性多座位聚合效应分析中应用.pdfVIP

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2017-08-10 发布于安徽
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MPVA软件设计及其在乳房炎易感性多座位聚合效应分析中应用.pdf

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第四部分疫病防治及保健 M PVA软件设计及其在乳房炎易感性多座位聚合效应分析中的应用张亚琴，杨章平。李志强。毛永江。张美荣。徐晓莉。冀德君 (动物育种与分子标记重点实验室，扬州大学，扬州225009) 摘要：【目的】以奶牛隐性乳房炎为例来介绍MPVA软件在多座位聚合效应分析中的应用．主要具体介绍MPVA 软件的原理、算法及操作。【方法】以南方某大型奶牛场634头(其中102头患乳房炎)中国荷斯坦牛为试验材料，采用PCR．SSCP、直接测序法分析CXCRl．5’端和编码区及IL82789／2862编码区两个基因共7个SNP位点遗传多态性， CXCRl．1830，CXCRl．1768和IL82789，2862三位点交互模型作为奶牛乳房炎易感性相关的基因联合选择模型最佳， MPVA可用于奶牛乳房炎易感性多基因分析模型．关键词：MPVA；聚合效应；乳房炎易感性中图分类号：$818．9 文献标识码：A The OfTheMPVAsoftwareAndThe OfItIn Design Using Analyzing The EffectinMastitis pyramiding Susceptibility ZHANG YANG Yong-jiang， Ya—qin， Zhang—pingl，LiZhi—qiang，MAO ZHANG Xiao—li，JI Mei—tong，XU De-jun and labofanimal molecular 225009) (Key breeding design，YangzhouUniversity,Yangzhou Abstract： ofthisarticleistointroducetheuseofMPVAsoftwarein [Objective】耶1epurpose we the effects．wetakeChineseHolsteinfor introduce analyzingpyramiding just example，then principle， and of7SNPsites the ofthesoftware．[Method】The 5’ algorithmoperation polymorphis．ms including and ofCXCRlandexon4andexon5ofIL8weredetectedbvPCR—SSCPand flankingregioncodingregion for 102individualmastitic onenorthernfarm direct 634Chinese COW,from sequencing Holstein，including ofChina．andto interactionofCXCRlandIL8andtheir ontheriskofmastiff