00000从头算分析NAD^+及NADP^+的电子传递.pdfVIP

维普资讯 第3卷第 1期 淮阴师范学院学报 (自然科学版) V01．3 No．1 2OO4年 2月 JOURNALOFHUAIYINTEACHERSCOLLEGE(NATURALSCIENCEEDmON) Feb．2004 从头算分析 NAD+及 NADP+的电子传递 宋远志 (淮阴师范学院 化学系，江苏 淮安 223300) 摘 要：用HF从头算计算NAD 及NADP 及其还原产物NADH及NADPH分子的绝对能量、 电荷分布、前线轨道能量、偶级距、键长、电子 自旋伸展空间，并讨论 了空间构形与电子传递的 关系，提出了NAD 及NADP在电极和生物氧化过程中传递电子的机理． 关键词：NAD ；NADP ；电子传递；从头算 中图分类号：O641．1 文献标识码 ：A 文章编号：1671．6876(2004)01．0050．04 生物氧化是由呼吸链传递的，NADH．泛醌还原酶位于线粒体的内侧，电子由还原型烟酰胺腺嘌呤二 核苷酸传递给泛琨(faUN)，NADPH常位于线粒体的外侧，与NADH具有相同的功能 ，用修饰 电极可以 模拟NAD 的电子传递 ．本文用量子理论计算了NAD 、NADP及NADH、NADPH分子总能量、电荷分 布、前线轨道能量、偶级距、键长、电子 自旋伸展空间，并尝试提出了NAD 及NADP传递电子的机理． 1 计算方法 MM2进行几何初始优化，在 gaussian98W计算软件上采用 Hartree．Foek方法进行全优化，在相同水 平计算 NAD 、NADP及 NADH、NADPH分子总能量、电荷分布、前线轨道能量、偶级距、键长、电子 自旋 伸展空间，计算基组为STO．3G． 2 计算结果 图1为NADPH优化后的几何构型及烟酰胺的键长． C 图 1 NADPH优化后的几何构型及烟酰胺的键长 收稿 日期：2003．11-08 基金项 目：江苏省教育厅 自然科学基金资助项 目(O1KJD15∞5o) 作者简介：宋远志(1964-)，男，湖北天门人，副教授，硕士，主要从事电化学及量子化学研究 维普资讯 第 1期 宋远志：从头算分析 NAD 及NADP 的电子传递 5l 2．1 分子的构形与活性基团键长的变化 图2为NADP+优化后的几何构型及烟酰胺的键长．从中可以看出，NADP 芳香烃位于磷酸根的两 侧，且距离较远，得电子后，杂环距离变近，且位于同一侧，这有利于与FMN靠近，且形成分子间作用力 (FUN亦含有N和O原子，可以形成氢键，氢键具有电催化作用酬 ，有利传递电子)，活性基团的C—N， C=C键长缩短，C—C键长伸长． ． I1．537 C H2 … 图2 NADP 优化后的几何构型及烟酰胺的键长 图3和图4为NADH、NAD 的构型及活性基团的键长，由于NADH、NAD 比NADPH及NADP 少一 个磷酸基团，NAD 的构型几乎为线性排列，NADH杂芳香环距离变近，活性基团的C—N，C=C键长缩 短，C—C键长伸长 ． nH 1． 356