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植保生物技术实验安排.doc
分组:第一组:植保1班(2号李丁-29号蓟晓玲)
第二组:植保1班(31号尹晓娟-56号郭嗣瑞)
第三组:植保2班(1号刘小慧-25号谢佼昕)
第四组:植保2班(26号吉夏洁-57号杨鹏飞)
每组一整天(上午8点,下午2点半)
共15个学时,所开实验如下:
实验一:生技实验室主要仪器介绍及注意事项
实验二:质粒DNA的制备
实验三:琼脂糖凝胶电泳检测DNA
实验四:运用多聚酶链式反应技术进行基因扩增
实验五:琼脂糖凝胶电泳检测PCR结果
实验一:生技实验室主要仪器介绍及注意事项
主要介绍进入实验室注意事项;主要仪器设备的用法及注意事项;有毒试剂的用法及注意事项等。
实验二:细菌基因组DNA的制备
细菌基因组DNAase A 除去。
三、仪器和试剂
(一)材料
细菌培养物。 设备
移液管, 高速冷冻离心机, 台式离心机,水浴锅。
试剂
1、CTAB/NaCl溶液:4.1g NaCl溶解于80ml H2 O,缓慢加入10g CTAB,加水至100ml。
2、其它试剂:氯仿:异戊醇(24:1),酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),异丙醇,70% 乙醇,TE,10% SDS,蛋白酶 K (20mg/ml或粉剂),5mol/L NaCl。
四、操作步骤:
1. 100ml 细菌过夜培养液, 5000rpm离心10分钟, 去上清液。
2. 加9.5ml TE悬浮沉淀, 并加0.5ml 10% SDS, 50μl 20mg/ml(或1mg干粉)蛋白酶 K, 混匀, 37℃保温1小时。
3. 加1.5ml 5mol/L NaCl, 混匀。
4. 加1.5ml CTAB/NaCl溶液, 混匀, 65℃保温20分钟。
5. 用等体积酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提, 5000rpm离心10分钟, 将上清液移至干净离心管。
6. 用等体积氯仿:异戊醇(24:1)抽提, 取上清液移至干净管中。
7. 加1倍体积异丙醇, 颠倒混合, 室温下静止10分钟,沉淀DNA。
8. DNA沉淀, 70%乙醇漂洗后, 吸干,溶解于1mlμg/ml)中室温放置一段时间, -20℃保存。
LoadingBuffer
4.DNA分子量标准参照物(DNA marker)
5.植物基因组DNA
6. 上样缓冲液(TBE)
四、实验步骤
(一)制备琼脂糖凝胶
1.取0.16g琼脂糖置入装有20ml 0.5X TBE的三角瓶中,微波炉加热沸腾使其溶于0.5X TBE中。加0.5μl溴化乙锭贮存液,混匀。
2.液温度降至65度左右,缓缓将其注入一个带有梳子的制胶床,避免有气泡产生。让胶在室温中冷却至凝固。在次期间:
1)准备DNA样品
2)胶凝固后,将胶床置于有0.5XTBE电极缓冲液的电泳槽中。通常,缓冲液高于胶面0.5cm。轻轻移去梳子,小心,不要使胶孔破裂。
(二)上样及电泳
1.吸取约含10ul的植物基因组DNA溶液,加2μl 10X LoadingBuffer,用移液器吸取,缓缓注入凝胶上的加样孔。
2.加样毕,用电源线连接电泳槽和电泳仪(注意正负极,DNA片段从负极向正极移动),打开电源,设定电压或电流,开始电泳。
(三)染色及观察
当指示剂迁移至凝胶约1-2cm处时,关闭电源取出凝胶,染色、脱色后在紫外灯上观察并拍照。
实验四:运用多聚酶链式反应技术进行基因扩增
一、实验目的
通过本实验学习PCR反应基本原理和实验技术
二、实验原理
PCR(polymerase chain reaction, PCR)技术快速敏感、简便易行,其原理与细胞体内发生的DNA复制过程十分相似。首先是双链DNA在临近沸点的温度下变性分离成两条DNA分子单链,然后DNA聚合酶以单链DNA为模板,以反应混合物中的寡聚核苷酸为引物,利用四种脱氧核苷三磷酸(dNTPs)合成新生的DNA互补链。PCR反应中所用的引物是按照与被扩增区段两端序列互补的原则设计的,这样每一条新生链的合成都是从引物的退火结合位点开始合成,沿着相反链延伸。因此,每一条新链上的起点就是下一轮扩增反应引物的结合位点。
从理论上讲,PCR反应n个循环之后的DNA的拷贝数应当是2n-2,经过30个循环反应,靶DNA在理论上可以得到109的扩增,实际上得到的大约是106到107倍的扩增。因此,靶DNA得以在体外快速大量合成。典型的PCR反应体系由以下组分组成:DNA模板,反应缓冲液,dNTPs,MgCl2,引物TaqDNA聚合酶。
PCR反应多次重复进行的温度循环周期均是由高温变性、低温退火和适温延伸三个步骤组成。一般,在变性温度为94到95度条件下,DNA变性分离成两条DNA分子单链;退火温度在不同的反应体系有所不同,主要是根据引物的解链温度
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