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3型鸭甲肝病毒C-GY株全长感染性克隆的构建和病毒拯救的鉴定.pdf
中国畜牧兽医学会禽病学分会第十五次学术研讨会论文集
1.2全序列测定根据已发表DHAV全序列设计
引物,提取病毒核酸,RT.PCR分段扩增不同毒株相
应区域,用RACE方法得到5’和3’端序列,克隆至相同。
2.2序列同源性分析DHAV的各基因区序列均
pEASY—Blunt载体,将鉴定为阳性的重组子测序。通
过DNAstar等软件进行序列拼接,并登录GenBank。表现出型内高度保守、型间较高变异的特点,仅2型
1.3序列分析从GenBank上下载已知DHAV全和3型的3’UTR表现出较高的同源性;在氨基酸水
W
序列,用CLUSTAL1.83进行氨基酸和核苷酸序列 平,2型和3型之间各非结构蛋白的序列均高度保
的比对和同源性分析。 守。分析这两个新型与1型之间的关系,可见2A和
2结果与分析 3AB蛋白的氨基酸序列变异性较高,而2B、2C、3C
2.1基因组特征与分型C—XNH和C—LGJ株的基和3D蛋白的氨基酸序列则较为保守(表1)。
表1 不同基因型DHAV型内和型间核苷酸(氨基酸)同源性比较
152:2059·2072.
参考文献
ofduck
[3】WangL,PanM,FuY.撕D.Classificationhepatitis
virusintothree basedOIImolecular analysis.
CH,TuiIIJ.Molecularchataaerkationofa M of genotypes evolutionary
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A virus fromclinical
hepatitis directly specimens.VmMicrobi01.
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hepatitis the—℃∞tma㈣geno-andserotype
2∞8,131:247.257.
duck virus I strain.Arch
Ⅻp删to hepsitistypetype Virol,2007,
3型鸭甲肝病毒C.GY株全长感染性克隆的构建和病毒拯救的鉴定
潘梦,杨小蓉,郭鑫,张大丙。,杨汉春‘
(中国农业大学动物医学院农业部人畜共患病重点实验室。北京海淀100193,-通讯作者E-ma
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