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DS2.5.5中的分子对接方法
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第二级
王昊 hwang@
第三级
2010-07-20
第四级
第五级 腾科技生命科学暑期培训班基础班创腾科技生命科学暑期培训班基础班
分子对接
根据几何匹配和能量匹配，寻找两个分子之间的最佳匹配（相互作用）模式。
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1
应用
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分子对接分类
生物大分子-小分子相互作用的理论
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锁-钥匙模型 诱导契合模型
刚性对接 半柔性对接 柔性对接
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受体受体、、配体均为刚性配体均为刚性 受体刚性受体刚性，配体柔性配体柔性 受体受体，配体均为柔性配体均为柔性
配体构象集 受体、配体构象集
或利用力学优化实现柔性
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2
分子对接的技术内幕
分子对接核心步骤
1. 搜索配体与受体的可能结合模式
• 配体的可能构象配体的可能构象
• 配体在活性位点的可能取向
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2. 对配体与受体的结合模式进行打分
• 经验打分函数
• 能量打分函数
• 一致性打分（Consensus Score ）
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分子对接要解决的问题
• 更可靠有效的搜索算法
• 更准确的打分函数
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DS中关于分子对接的方案
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