胃癌与慢性萎缩性胃炎基因表达谱的差异与关联_吴建新.pdfVIP

胃癌与慢性萎缩性胃炎基因表达谱的差异与关联_吴建新.pdf

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5 中国癌症杂志6 2008年第 18卷第 2期 118 CH INA ONCOLOGY 2008 Vol. 18 No. 2 胃癌与慢性萎缩性胃炎基因表达谱的差异和关联 1 1 2 1 吴建新 张燕 张庆华 李定国 1. 上海交通大学医学院附属新华医院消化内科, 上海 200092; 2. 国家生物芯片工程上海 究中心, 上海 201303 [摘要] 背景与目的: 胃黏膜自慢性炎症演变为胃癌的过程中, 隐伏着一系列的基因变化。本 究采用高通 量基因芯片, 检测慢性萎缩性胃炎和胃癌组织的基因表达, 结合病理资料, 分析和比较两者基因表达的异常及其生 物学意义。方法: 收集 23例胃癌以及 15例慢性萎缩性胃炎的病变及配对非病变部位胃粘膜组织, 以载有 13 824 个基因 /EST序列的基因芯片检测基因表达谱, 结合病理等临床资料, 应用系统聚类法、t检验、F isher确切概率法等 统计学方法进行分析。结果: 胃癌组和慢性萎缩性胃炎组分别筛选出符合条件的基因 53 个和 21个。胃癌组的特 征性表达基因中, STS、HAP1等基因与 Borrm a 分型等病理改变相关联;慢性萎缩性胃炎组的特征性表达基因中, BRD3、BF508879等基因与肠化等病理改变相关联; 慢性萎缩性胃炎和胃癌组中共同存在的 SLC26A3等基因与癌 前病变相关联。结论: 慢性萎缩性胃炎和胃癌组织基因的表达既有相似性, 又有异质性。肿瘤基因表达与癌前状 态和癌前病变相关。基因表达的相似性提示慢性萎缩性胃炎与胃癌这两者病理发展的相关性和延续性。 [关键词] 基因芯片; 胃癌; 慢性萎缩性胃炎; 聚类分析; 关联 中图分类号: R730. 2R735. 2 文献标识码: A 文章编号: 100723639( 2008) 0220118206 Th e difference and r elation sh ip of gene expression profiles between gastr ic cancer and chr onic a2 tr oph ic gastr itis WU J ian2xin, ZHANG Yan, ZHANGQing2hua, LIDin2guo (Department ofGastroenter2 olog , Xinhua Hospital, Medical School of Shanghai J iaoTong Universit , Shangha i200092, China ) Correspondence to: ZHANG Yan E2mail:wjxgp@ sh163. net [Ab stract] Background and purp ose: The developm e t of gastric ca cer has a lo g course from chro icmucosal i 2 flamm atio a d i volves a lot ofge es. W e i vestigated the d iffere t ge e expressio profilesw ith ge e ch ip ofh igh flux be2 wt ee gastric ca cer a d chro ic atrophic gastritis so as to a aly

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