郝晨阳 SSR荧光标记和银染技术的比较分析【荐】.pdfVIP

第 31 卷 第 2 期 作 　物 　学 　报 Vol31 , No2 2005 年 2 月 　144～149 页 ACTA AGRONOMICA SINICA pp 144 - 149 　Feb , 2005 SSR 荧光标记和银染技术的比较分析 郝晨阳　王兰芬 　贾继增　董玉琛　张学勇 ( 中国农业科学院作物品种资源研究所,农业部作物品种资源与生物技术重点实验室 ,北京 100081) ( ) ( 摘 　要 : 应用多重 PCR 简单重复序列 SSR 荧光标记分析技术和常规的 SSR 银染技术 ,对北方冬麦区 451 份材料 中国 ) 小麦初选核心种质的一部分 进行分析 ,用相同材料和引物 ,对这两种方法的检测效果进行评价。用 24 对引物扩增 ,银 染法共检测出 235 个等位变异 ,每个位点检测到的等位变异为 3～20 ,平均为 98 个 ,多态性信息指数 PIC 为 022～093 , 平均 074 ;而荧光标记可检测到 312 个等位变异 ,每个位点检测到的等位变异为 4 ～24 ,平均为 130 个 , PIC 为 032～ 097 ,平均 075 。荧光技术较银染方法在每个位点上多检测到 3 个等位变异 ,检测效果更为理想 ,更适于进行遗传多样 性分析和研究 ;对两种方法的费用和工作效率做了初步分析 ,表明完成 5 000 ×78 个反应在费用基本持平的情况下 ,微卫 ( ) 星荧光标记技术的检测效率显著高于银染法 78 倍 。同时对微卫星荧光标记技术中低成本、高通量多重 PCR 体系的 建立及 Genescan 37 、Genotyper 37 软件数据分析中出现的一些具体问题进行了探讨。 关键词 : 小麦 ; 微卫星 ; 荧光 PCR ; 基因组扫描 中图分类号: S512 ,Q78 Comparison of Fluorescence and Silverstaining Detection Systems of Microsatellite Markers HAO ChenYang ,WANGLanFen ,J IA JiZeng ,DONG YuChen ,ZHANG XueYong ( Key Laboratory of Crop Germplasm and Biotechnology , Ministry of Agriculture , Institute of Crop Germplasm Resources , Chinese Academy of Agricultural Sciences , Beijing 100081 , China) Abstract :Fourhundred and fiftyone wheat cultivars from Northern Winter Wheat Region were analyzed by fluorescence based genescan with multiple PCR microsatellite markers and SSR marker technology based on silver staining In the same cultivars and the same set of SSR primers ,