霍乱弧菌分型噬菌体VP3基因组序列的测定和分析.pdfVIP

卷 期 ! # 微 生 物 学 报 ’() *! 1( *# 年 月 $%% $ !#$ %’()(*(+$ ,-$ +,-,./,0 $%% !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! 霍乱弧菌分型噬菌体!# 基因组序列的测定与分析 ， ， $ $ 4 $ ! $ 赵英伟 王多春 汪 敏 李燕萍 阚 飙 $ （苏州大学基础医学院 苏州 $$4 ） （中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 北京 %$$%# ） 4 ! （国家人类基因组南方研究中心 上海 $%$%4 ） （南昌大学中德联合研究院 南昌 44%%!3 ） 北京大学医学部 北京 ） （ %%%74 摘 要：测定和分析霍乱弧菌分型噬菌体’I4 基因组序列，并为) 6(0 型霍乱弧菌两类菌株的分型方法原理提供 研究基础。鸟枪法构建’I4 噬菌体全基因组随机文库；测序拼接成最小重叠群，引物步移法填补缝隙序列，拼接后 获得 全基因组序列。 随机扩增噬菌体 片段并酶切鉴定；预测可能存在的开放读码框（ ）；对 ’I4 IJK +1L MK9 ’I4 和相关噬菌体的+1L 聚合酶基因作进化树分析，协助判定’I4 的分类；对预测的部分启动子区利用报道基因进行 活性分析。 全基因组为环状双链 ，长度 ；酶切鉴定结果与序列一致。确定了 个 ，注释了 ’I4 +1L 42%!/N !2 MK9 $3 个 的编码产物，其中有 个基因产物与 样噬菌体同源，包括 聚合酶（ ）、参与 复制的蛋白、 MK9 $% 63 K1L K1LI +1L 衣壳蛋白、尾管及尾丝蛋白、 包装蛋白等。 聚合酶（ ）进化树分析表明 与 样噬菌体有同源性。 +1L +1L +1LI ’I4 63 将预测的% 个启动子序列克隆到):-O 融合质粒NKP$3! 上，经检测均具有启动子活性。测定和分析’I4 的基因组 序列，基因组结构与进化树分析提示 属于 噬菌体家族。 ’I4 63 关键词：霍乱弧菌，噬菌体 ，基因组 ’I4 中图分类号： 文献标识码： 文章编号： （ ） Q37 L %%%8#$%2 $%% %#8%78% 霍乱是由霍乱弧菌引起的急性肠道传染病，是