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三、 核糖体 真核生物的核糖体一部分在细胞质中呈游离状态,另一部分与内质网结合,形成粗面内质网。此外在其线粒体和叶绿体中也有核糖体。 原核生物的核糖体存在于细胞质中; 核糖体是一个巨大的核糖核蛋白体 2. 核糖体的组成 36-50种 30-32种 31种 21种 蛋白质 28S、5S、5.8S 60S 18S 40S 80S 真核生物 23S、5S 50S 16S 30S 70S 原核生物 rRNA 核糖体 三、 核糖体 2. 核糖体的组成 三、 核糖体 A three-dimensional model for the E.coli ribosome mRNA结合部位: 大小亚基之间存在一条细沟,用于接纳mRNA; 此外,小亚基的16S rRNA可以与mRNA相互作用,从而参与mRNA与核糖体的结合。 ? 3. 核糖体上的活性部位 (1) 结合部位 三、 核糖体 3. 核糖体上的活性部位 tRNA结合部位:有2个 氨酰基部位(A位)—— 氨酰tRNA的结合部位 肽基部位 (P位) —— 正在延长的多肽基 tRNA的结合部位; tRNA的这两个结合部位有一小部分在30S亚基内,大部分在50S亚基内。 三、 核糖体 催化肽键形成的部位: 称为肽基转移酶,又叫转肽酶。位于大亚基上。 1992年发现该活性是由23S rRNA提供的。? 3. 核糖体上的活性部位 (2) 催化部位 催化GTP水解的部位: 位于大亚基上,在核糖体移位期间将GTP水解成GDP和Pi。 (1) 结合部位 三、 核糖体 四、tRNA The general structure of tRNA molecules 四、tRNA 被特定的氨酰-tRNA合成酶所识别。 识别mRNA链上的密码子,这是因为tRNA上有3个特定碱基组成的一个反密码子与mRNA链上的密码子配对,保证氨基酸按mRNA的碱基顺序入号。 tRNA将多肽链联结在核糖体上。 tRNA的功能 五、辅助因子 在蛋白质合成体系中,还有溶解在胞质中的蛋白质,在蛋白质合成的不同阶段起作用,分别有: 起始因子(IF):原核生物中有IF1、IF2、IF3 延长因子(EF):原核生物中有EF-Tu、EF-Ts、EF-G 终止因子(RF):原核生物中有RF1、RF2、RF3 蛋白质因子 五、辅助因子 ATP、GTP、Mg2+ 其它因子 第二节 蛋白质的生物合成 一、氨基酸的活化 游离氨基酸掺入多肽链以前必须活化即氨基酸与特异tRNA形成氨酰-tRNA。原因有两个:第一,蛋白质的合成依赖于tRNA的接头作用,以保证正确的氨基酸得到整合,每个氨基酸为了参与蛋白质合成必须共价连接到tRNA分子上。第二,氨基酸与tRNA之间形成的共价键是一个高能键,它使氨基酸和正在延伸的多肽链末端反应形成新的肽键,因此, 这一氨酰-tRNA的合成过程被称为氨基酸的活化 1.氨酰-tRNA的形成 氨基酸的活化是指氨基酸与tRNA相连,形成氨酰-tRNA的过程。 氨基酸的活化在细胞质中进行。反应由氨酰-tRNA合成酶(又称氨基酸活化酶)催化。 1.氨酰-tRNA的形成 氨基酸羧基通过酸酐键与AMP上的5?-磷酸基相连 氨酰-tRNA合成酶: 此酶具有较高专一性,能有效识别tRNA和相应的氨基酸。 此酶具有校对功能。 活化一个氨基酸消耗2分子ATP。 1)识别mRNA的起始密码子为AUG,而AUG对应的氨基酸为Met。 2)有两种甲硫氨酸专一性的tRNA: tRNAfmet—只与起始密码子结合 tRNAmmet—只与肽链内部的AUG有关 在原核生物中,多肽链起始的氨基酸均为甲酰甲硫氨酸。 2. 起始氨酰tRNA的形成 在真核生物中,多肽链起始的氨基酸均为甲硫氨酸 tRNAimet—只与起始密码子结合 tRNAmet—只与肽链内部的AUG有关 2. 起始氨酰tRNA的形成 原核生物中的fMet-tRNA的合成 Met + ATP + tRNA ? Met – tRNA + AMP + PPi 甲硫氨(蛋氨)酰tRNA合成酶 原核生物中的fMet-tRNA的合成 Met-tRNA在转甲酰酶的作用下,在其Met的-NH2上甲酰化。 fMet – tRNA 在翻译的起始阶段,还需有3种蛋白质因子 —— 起始因子(IF)的参与,即IF1、IF2、IF3。 此时核糖体的P位被起始氨酰-tRNA占据,A位空着,等待能与第二个密码子匹配的氨酰-tRNA进位。? 起始复合物的结构: 二、多肽链合成的过程 1. 起始 指核糖体与mRNA及起始氨酰-
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