NCBI提交序列的方法.docVIP

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NCBI提交序列的方法.doc

介绍一、 进入NCBI网站,左侧有sequence submissions ,点击进入Submit to GenBank利用BankIt在线投递,特点是比较方便,你按照程序的说明一步步跟着操作就可以了,满简单的。 从NCBI的ftp上下载提交序列的软件sequin,利用软件进行提交。NCBI的ftp地址是 两中方法都不难,如果不懂的话找个说明书看一下就可以了,一般如果你只提交单条序列的话可以到NCBI的站点上利用方法1直接提交就可以了,比较简单。但是如果你想批量提交很多条序列的话,最好用sequin软件,这样更具有效率。 介绍二、 转帖(from 生技论坛bbschief )略有改动 向NCBI提交序列常用的程序有两个,一个是在线提交的BankIt,一个是用软件Sequin。用那种办法,根据不同的需要。 BankIt: (在线提交页面:/BankIt/ 1.适合单个或少量几个的提交 2.喜欢用在线的方式提交,无需下载个软件 3.你的序列的注释不复杂 4.提交你的序列时不需要用到序列的分析 Sequin(下载页面:/Sequin/index.html) 1.提交的是批量而且比较复杂的序列 2.you are submitting mutation, phylogenetic, population, environmental, or segmented sets 3.喜欢图形的界面,有更的选项和功能,可以批量修改 4.获得相关的分析工具 这里简单介绍一下在线提交序列程序BankIt,Sequin也是大同小异的。 1,进入GenBank 2,左栏点击Submit to GenBank 3,左边出现几个工具的选择,点击BankIt。在BankIt提交页面的最下面,填上你要提交的序列的长度,点New 4,点New后,会生成一个bankit号,记住这个号。下面根据需要填写一些必需的内容。名字啊,序列之类的 5,填好资料后,你可以保存一份在你的电脑。如果确认无误,点提交(Validate and continue) 6,如果你填的资料有误,或漏填了。就会有ERROR的提醒。像名字,电话,Email,序列等都是必须的。最后NCBI会给您发个邮件,等过几个月后如果没有问题就能得到您的登录号了,如果有问题NCBI会邮件和您联系。如果是用Sequin,填好资料过程中可以随时保存,最后你只需把最后确认的文件向NCBI发封邮件就可以了。 本人是在他人指点下进行了操作,假如你选择“--To be released immediately after processing”递交成功后立刻就收到“gb-admin@”发来的邮件,显示你递交的新基因的信息,两天后还会收到登陆号;再过一段时间将会收到正式文件通知。 如何向NCBI提交基因序列 2011-03-29 19:44:36|??分类: 知识点滴 阅读93 评论0 ??字号:大中小?订阅 向NCBI提交序列常用的程序有两个,一个是在线提交的BankIt,一个是用软件Sequin。用那种办法,根据不同的需要。 BankIt: (在线提交页面:/BankIt/ 1.适合单个或少量几个的提交 2.喜欢用在线的方式提交,无需下载个软件 3.你的序列的注释不复杂 4.提交你的序列时不需要用到序列的分析 Sequin(下载页面:/Sequin/index.html) 1.提交的是批量而且比较复杂的序列 2.you are submitting mutation, phylogenetic系统发育的, population, environmental, or segmented sets 3.喜欢图形的界面,有更的选项和功能,可以批量修改 4.获得相关的分析工具 这里简单介绍一下在线提交序列程序BankIt,Sequin也是大同小异的。 1,进入GenBank 2,左栏点击Submit to GenBank 3,左边出现几个工具的选择,点击BankIt。在BankIt提交页面的最下面,填上你要提交的序列的长度,点New 4,点New后,会生成一个bankit号,记住这个号。下面根据需要填写一些必需的内容。名字啊,序列之类的 5,填好资料后,你可以保存一份在你的电脑。如果确认无误,点提交(确认Validate and continue) 6,如果你填的资料有误,或漏填了。就会有ERROR的提醒。像名字,电话,Email: gb-admin@,序列等都是必须的。 用Sequin软件编写好,你要提交的序列和基本信息之后。在research下拉栏里面,点击Validate,确认无误。就可以给Email: gb-admin@写封邮件,把用Sequin软件编辑好的数据上传上去。 一切成功之后,就可以收到一封自动回信了。

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