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环状分子结构的规范化表征方法.pdf

第 15 卷 第 4 期 计算机与应用化学 V o l. 15 N o. 4 1998 年 7 月 28 日 Computers and A pp lied Chem istry  July 1998 ·研究论文· 环状分子结构的规范化表征方法① ② 何敏  姚建华  袁身刚   郑崇直 ( 中国科学院上海有机化学研究所, 中国科学院计算机化学开放实验室 上海 200032) 摘 要 本文介绍了一种表征各种类型环状结构的规范化新方法。结构的规范化是通过对结构进行拓扑 对称性、原子连接度、原子性质、邻接键型、邻接权重和、伪树码等分析得到的。同时文中还介绍了本系统使 用的一种简便的紧缩连接表的结构存贮方法。 关键词 规范化, 优先规则, 拓扑对称性, 伪树码, 紧缩连接表 中图号 O 621. 14,  T P 392,  O 624, O 625 THE CHARACTER IZAT ION OF CYCL IC STRUCTURES   -   -   - HE M in YAO J ian hua Y UAN Shen gang ZHENG Chong zh i ( , L aboratory of Comp u ter Chem istry S hang hai Institu te of O rg anic Chem istry , Ch inese A cad emy of S ciences },  S hang hai 200032) ABSTRACT In th is paper , a new app roach fo r characterizing diverse cyclic structures is discussed. T he canonicalization of the structures is ach ieved by analyzing the topo logical symm etry, connectivities of , , , - . atom s atom p roperty bond type sum of neighbo r w eigh tings and quasi tree code of the structure A simp le compact structure sto rage m ethod used in the system is also p resented. KEYWORD S Canonicalization,  P rio rity criterion,  Topo logical symm etry,  Q uasi- tree code, Compact connectio

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