Gene Structure and Expression.ppt

第一节基因与人类基因组计划 基　因　组　学 Genomics *功能基因组学 *比较基因组学 比较基因组学(comparative genomics)涉及比较不同物种的整个基因组，以便深入理解每个基因组的功能和进化关系。 二.基因组学与医学关系 *疾病相关基因的鉴定 （一）检测人类基因变异或突变 （二）疾病时基因组差异表达分析 （三）染色体制图定位及疾病相关基因克隆 *基因组学与肿瘤病因学 *基因组学与流行病病因学 *基因组学与医学伦理、法律和社会问题 第 二 节  原核基因转录调节 第 三 节  真核基因转录调节 是RNA聚合酶结合并启动转录的特异DNA序列。 1) 启动序列 RNA转录起始 -35区 -10区 TTGACA TTAACT TTTACA TATGAT TTTACA TATGTT TTGATA TATAAT CTGACG TACTGT N17 N16 N17 N16 N16 N7 N7 N6 N7 N6 A A A A A trp tRNATyr lac recA Ara BAD TTGACA TATAAT 共有序列 共有序列(consensus sequence) 决定启动序列的转录活性大小。 某些特异因子（蛋白质）决定RNA聚合酶对一个或一套启动序列的特异性识别和结合能力。 2? 操纵序列 ——阻遏蛋白(repressor)的结合位点 当操纵序列结合有阻遏蛋白时，会阻碍RNA聚合酶与启动序列的结合，或是RNA聚合酶不能沿DNA向前移动 ，阻碍转录。 启动序列 编码序列 操纵序列 pol 阻遏蛋白 3) 其他调节序列、调节蛋白 例如 激活蛋白(activator)可结合启动序列邻近的DNA序列，促进RNA聚合酶与启动序列的结合，增强RNA聚合酶活性。 真核生物 1) 顺式作用元件(cis-acting element) ——可影响自身基因表达活性的DNA序列 B A DNA 编码序列 转录起始点 不同真核生物的顺式作用元件中也会发现一些共有序列 ，如TATA盒、CAAT盒等，这些共有序列是RNA聚合酶或特异转录因子的结合位点。 2) 真核基因的调节蛋白 还有蛋白质因子可特异识别、结合自身基因的调节序列，调节自身基因的表达，称顺式作用。 由某一基因表达产生的蛋白质因子，通过与另一基因的特异的顺式作用元件相互作用，调节其表达。 反式作用因子(trans-acting factor) 这种调节作用称为反式作用。 c DNA a DNA 反式调节 C 顺式调节 mRNA C 蛋白质C B A mRNA 蛋白质A A 指的是反式作用因子与顺式作用元件之间的特异识别及结合。通常是非共价结合，被识别的DNA结合位点通常呈对称、或不完全对称结构。 绝大多数调节蛋白质结合DNA前，需通过蛋白质-蛋白质相互作用，形成二聚体(dimer)或多聚体(polymer)。 2. DNA - 蛋白质 蛋白质-蛋白质 的相互作用 3. RNA聚合酶 ⑴ 原核启动序列/真核启动子与RNA聚合酶活性 RNA聚合酶与其的亲和力，影响转录。 ⑵ 调节蛋白与RNA聚合酶活性 一些特异调节蛋白在适当环境信号刺激下表达，然后通过DNA-蛋白质、蛋白质-蛋白质相互作用影响RNA聚合酶活性。 Regulation of Prokaryotic Gene Transcription ——调节的主要环节在转录起始 一、原核基因转录调节特点 （一）σ因子决定RNA聚合酶识别特异性 （二）操纵子模型的普遍性 （三）阻遏蛋白与阻遏机制的普遍性 二、乳糖操纵子调节机制 （一）乳糖操纵子(lac operon)的结构 调控区 CAP（代谢产物激活蛋白）结合位点 启动序列 操纵序列 结构基因 Z： β-半乳糖苷酶 Y： 透酶 A：乙酰基转移酶 Z Y A O P DNA mRNA 阻遏蛋白 I DNA Z Y A O P pol 没有乳糖存在时 （二）阻遏蛋白的负性调节 阻遏基因 与操纵序列结合，RNA 聚合酶则不起作用，不转录 mRNA 阻遏蛋白 有乳糖存在时 I DNA Z Y A O P pol 启动转录 mRNA 乳糖 半乳糖 β-半乳糖苷酶 + + + + 转录 无葡萄糖，cAMP浓度高时 有葡萄糖，cAMP浓度低时 （三）cAMP-CAP的正性调节 Z Y A O P DNA CAP CAP CAP CAP CAP CAP （四）协调调节 ※当阻遏蛋白封闭转录时，CAP对该系统不能发挥作用； ※如无CAP存在，即使没有阻遏蛋白与操纵序列结合，操纵子仍无转录活性。 单纯乳糖存在时，细菌利用乳糖作碳源； 若有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在时，细菌首先利用葡萄糖