16S rRNA测序在细菌鉴定中的应用.pdfVIP

( ) 第 24 卷 第 5 期 北京工商大学学报 自然科学版 V o l24 N o 5 2006 年 9 月 Journal of Beijing T echno logy and Business U niversity ( Science Edition) Sep. 2006 10 N atural ( ) 　　文章编号: 2006 16S rRNA 测序在细菌鉴定中的应用 龙　雯, 　陈存社 (北京工商大学 化学与环境工程学院, 北京　100037) 摘　要: 对分离获得的一株细菌 29, 经聚合酶链式反应扩增后测定该菌株的 16 基因序 P S rRNA 列, 由16 基因序列比较可知, 菌株 29 与肠杆菌属和泛菌属亲缘关系最为接近, 16 S rRNA P S rRNA 基因相似性达到 99% 结合生理生化实验结果综合分析后, 将其鉴定为泛菌属的成团泛菌 关键词: 16S rRNA ; 细菌鉴定; 成团泛菌 中图分类号: Q 93331　　　　　文献标识码: A 　　生物细胞DNA 分子的一级结构中既具有保守 和 23S 5S 和 23S rRNA 基因在 50S 亚基中, 16S 的片段, 又具有变化的碱基序列[ 1 ] 保守的片段反映 rRNA 在 30S 亚基中, 它们是核糖体不可缺少的成 了生物物种间的亲缘关系, 而高变片段则能表明物 分 16S rRNA 基因是细菌染色体上编码 rRNA 相 种间的差异 那些保守的或高变的特征性核苷酸序 对应的DNA 序列, 存在于所有细菌的染色体基因 ( ) 组中 16S rRNA 基因约由 1540 个核苷酸组成, 并 列则是不同分类级别生物 如科、属、种 鉴定的分子 ( ) 基础, 因此可根据 rDNA (核糖体DNA ) 序列设计用 含有多个拷贝 即转录单位 , 如大肠杆菌 K 12 染色 于某一种、属、科甚至更大类群范围的微生物检测或 体基因组中, 含 7 个 16S rRNA 拷贝, 而在一般情况 鉴定的探针[ 2 ] 细菌中 rRNA ( 即 rDNA ) 高度保守, 下, 细菌的其他结构基因都是单拷贝的 以 16S rRNA 为聚合酶链式反应(PCR ) 扩增靶分子 细菌 16S rRNA 基因序列由保守区和可变区组 的细菌快速分类鉴定的标准方法已经成功建立, 该 成, 两者互相交错排列 编码 rRNA 基因与细菌整 方法可以应用于细菌种、属和科的鉴定及系统进化 个基因组的